慢性淋巴细胞白血病细胞RNA测序转录组分析
该数据集来自ebi.ac.uk,为慢性淋巴细胞白血病(CLL)细胞的RNA测序转录组分析数据,主题标签为RNA-seq of coding RNA与Homo sapiens,本站分类为肿瘤/白血病

基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病细胞RNA测序转录组分析
Transcriptome analysis in chronic lymphocytic leukemia cells using RNA sequencing (RNA-seq)
该数据集来自ebi.ac.uk,为慢性淋巴细胞白血病(CLL)细胞的RNA测序转录组分析数据,主题标签为RNA-seq of coding RNA与Homo sapiens,本站分类为肿瘤/白血病。源站描述涉及CLL的生物学与临床异质性、IGHV基因体细胞超突变状态作为预后标志物,以及基于RRBS的CD19+ B细胞全基因组DNA甲基化分析,并提及CLL特异性DMR与IGHV特异性DMR的识别。该数据可用于CLL分子分型、预后相关标志物及甲基化与转录组关联研究(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性淋巴细胞白血病(CLL)是一种在生物学和临床上具有异质性的疾病。免疫球蛋白重链可变(IGHV)基因的体细胞超突变状态已被确定为CLL中最稳健的预后标志物之一。IGHV状态未突变的患者(U-CLL)通常比克隆表达突变IGHV基因的患者(M-CLL)预后更差。我们使用简化代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)对一组43例CLL患者的CD19+ B细胞进行了全基因组DNA甲基化分析。使用碱基对分辨率的甲基化测序,在CLL基因组中识别出CLL与正常B细胞之间的2323个差异甲基化区域(CLL特异性DMR)以及M-CLL与U-CLL样本之间的569个差异甲基化区域(IGHV特异性DMR)。与CLL特异性DMR相比,IGHV特异性DMR大多是独特的。不到10%的
【主题与分类】
主题标签:RNA-seq of coding RNA、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-66117
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- OpenDataLab:
数据说明
Huidong Shi (2015). Transcriptome analysis in chronic lymphocytic leukemia cells using RNA sequencing (RNA-seq) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-66117
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