成人初治急性髓系白血病骨髓或外周血单个核细胞转录组分析：构建正常核型AML预后基因特征

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-12417

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数据说明

细胞遗传学正常的急性髓系白血病(CN-AML)患者表现出异质性的治疗结果。我们利用基因表达谱分析来开发一个预测CN-AML总生存期(OS)的基因特征。基于德国AMLCG 1999试验中163名患者的数据，并在寡核苷酸微阵列上进行分析，我们采用监督主成分分析识别出86个与OS相关的探针集(代表66个不同基因)，并基于此特征定义了一个预后评分。当应用于一个独立的79名CN-AML患者队列时，这一连续评分仍是OS(风险比[HR]，1.85；P=0.002)、EFS(HR，1.73；P=0.001)和RFS(HR，1.76；P=0.025)的显著预测因子。在调整年龄、FLT3 ITD和NPM1状态的多变量分析中，它保持了其预后价值。在一个接受CALGB研究9621治疗的64名CN-AML患者的验证队列中，该评分也预测了OS(HR，4.11；P<0.001)、EFS(HR，2.90；P<0.001)和RFS(HR，3.14，P<0.001)，并在OS的多变量模型中保持了其显著性。

总之，我们提出了一种新的基因表达特征，为CN-AML患者提供了额外的预后信息。实验总体设计：对163份来自未经治疗的成人急性髓系白血病患者的骨髓或外周血单核细胞样本进行分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。