意义未明单克隆丙种球蛋白病、多发性骨髓瘤或浆细胞白血病患者人浆细胞的转录谱分析

该数据集来自 omicsdi.org,包含从 7 例意义未明单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、39 例新诊断多发性骨髓瘤(MM)和 6 例浆细胞白血病(PCL)患者骨髓中纯化的浆细胞(PCs)的基因表达谱

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时间序列分类Transcriptomics
Transcription profiling of human plasma cells from patients with monoclonal gammopathy of undetermined significance, multiple myeloma or plasma-cell leukaemia

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

意义未明单克隆丙种球蛋白病、多发性骨髓瘤或浆细胞白血病患者人浆细胞的转录谱分析

该数据集来自 omicsdi.org,包含从 7 例意义未明单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、39 例新诊断多发性骨髓瘤(MM)和 6 例浆细胞白血病(PCL)患者骨髓中纯化的浆细胞(PCs)的基因表达谱。浆细胞经红细胞裂解和 CD138 免疫磁珠分选,纯度经形态学和流式细胞术评估均大于 90%。总 RNA 经处理并杂交到 Affymetrix HG-U133A 芯片,扫描后用 Affymetrix MicroArray Suite (MAS) 5.0 软件生成表达强度值,并采用 MAS 5.0 全局缩放进行归一化。该数据可用于研究三种浆细胞疾病之间的转录差异,并支持分类建模(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本系列微阵列实验包含从 7 例意义未明单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、39 例新诊断多发性骨髓瘤(MM)和 6 例浆细胞白血病(PCL)患者中纯化的浆细胞(PCs)的基因表达谱。PCs 在红细胞用 0.86% 氯化铵裂解后,使用 CD138 免疫磁珠从骨髓 Seriess 中纯化。通过形态学和流式细胞术评估阳性选择 PCs 的纯度,所有病例均 > 90%。按照制造商说明,处理 5 微克总 RNA 并杂交到 Affymetrix HG-U133A 芯片。扫描后,使用 Affymetrix MicroArray Suite (MAS) 5.0 软件处理图像以生成基因表达强度值。使用 MAS 5.0 全局缩放程序进行阵列归一化,该程序将信号归一化

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2113

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该系列微阵列实验包含从7例意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、39例新诊断的多发性骨髓瘤(MM)和6例浆细胞白血病(PCL)患者中获取的纯化浆细胞(PCs)的基因表达谱。在骨髓Seriess中,使用0.86%氯化铵裂解红细胞后,通过CD138免疫磁珠纯化PCs。通过形态学和流式细胞术评估阳性选择的PCs纯度,所有病例的纯度均>90%。按照制造商说明,处理5微克总RNA并杂交至Affymetrix HG-U133A芯片。扫描后,使用Affymetrix MicroArray Suite (MAS) 5.0软件处理图像,以生成基因表达强度值。使用MAS 5.0全局缩放程序进行阵列归一化,该程序将不同实验的信号归一化至相同的目标强度(TGT=100)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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