慢性髓性白血病患者对imatinib不同反应的白细胞转录组分析
该数据集来自omicsdi.org，包含慢性髓性白血病（CML）患者对imatinib（Gleevec）反应状态的转录组数据
基本信息
资源简介
慢性髓性白血病患者对imatinib不同反应的白细胞转录组分析
该数据集来自omicsdi.org，包含慢性髓性白血病（CML）患者对imatinib（Gleevec）反应状态的转录组数据。数据分为训练集（来自Leipzig，8例响应者与5例非响应者）和验证集（来自Mannheim，8例响应者与7例非响应者）。样本取自患者血液或骨髓，杂交至Affymetrix HG-U95Av2芯片，并使用RMA生成归一化信号值。该数据可用于识别响应与非响应患者之间的差异表达基因，并构建分类模型预测imatinib反应（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：这是一个类别预测实验，其中类别是对imatinib（也称为Gleevec）的反应状态，imatinib是一种用于治疗慢性髓性白血病（CML）患者的药物。有两个数据集，一个训练集（来自Leipzig，8个响应者和5个非响应者）和一个验证集（来自Mannheim，8个响应者和7个非响应者）。目标是识别对imatinib有反应和无反应的CML患者之间差异调控的基因，并在验证数据集中确认结果。来自CML患者血液或骨髓的样本与Affymetrix HG-U95Av2芯片杂交，并使用RMA生成归一化信号值。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2535
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2535
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
这是一个类别预测实验，其中类别是对伊马替尼（也称格列卫）的反应状态，伊马替尼是一种用于治疗慢性髓性白血病（CML）患者的药物。有两个数据集，一个训练集（来自莱比锡，8名响应者和5名非响应者）和一个验证集（来自曼海姆，8名响应者和7名非响应者）。目标是识别对伊马替尼有响应和无响应的CML患者之间差异调控的基因，并在验证数据集中确认结果。将来自CML患者血液或骨髓的样本与Affymetrix HG-U95Av2芯片杂交，并使用RMA生成归一化的信号值。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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