人BCR-ABL阳性与阴性成人急性淋巴细胞白血病样本转录谱分析
该数据集来源于omicsdi.org，包含MRC UKALLXII/ECOG E2993组间研究中37例BCR-ABL阳性（其中21例表达p185、16例表达p210）和17例BCR-ABL阴性成人急性淋巴细胞白血病（ALL）样本的基因表达谱数据
基本信息
资源简介
人BCR-ABL阳性与阴性成人急性淋巴细胞白血病样本转录谱分析
该数据集为成人急性淋巴细胞白血病（ALL）的基因表达谱研究数据，来源于omicsdi.org，属于肿瘤/白血病分类下的转录组学主题数据。数据集聚焦于BCR-ABL融合基因阳性与阴性的成人ALL样本对比，共纳入54例标本，其中37例为BCR-ABL阳性，17例为BCR-ABL阴性。在阳性样本中，21例表达p185亚型，16例表达p210亚型。所有样本均来自MRC UKALLXII/ECOG E2993组间研究。研究者通过基因表达谱检测，旨在揭示与BCR-ABL致癌机制相关的分子机制和通路。该数据集为白血病分子分型、融合基因亚型差异及靶向机制研究提供了可用的转录组层面资料。
【数据集背景】
BCR-ABL融合基因是白血病发生中的关键分子事件之一，其不同亚型（如p185与p210）在疾病表型和生物学行为上可能存在差异。成人急性淋巴细胞白血病中，BCR-ABL阳性患者与阴性患者在临床特征和分子机制上存在区别。该数据集正是围绕这一背景，基于MRC UKALLXII/ECOG E2993组间研究中的成人ALL标本，构建BCR-ABL阳性与阴性样本的基因表达谱，以支持对BCR-ABL致癌机制及相关分子通路的探索。数据集所属分类为肿瘤/白血病，主题标签为Transcriptomics，体现了其在肿瘤转录组研究中的定位。
【数据内容】
数据集包含37例BCR-ABL阳性成人ALL样本和17例BCR-ABL阴性成人ALL样本的基因表达谱数据。阳性样本中，21例表达p185亚型，16例表达p210亚型。样本总数为54例。数据内容为基因表达谱检测结果，可用于比较BCR-ABL阳性与阴性样本之间、以及不同BCR-ABL亚型之间的表达差异。源站描述指出，该结果有助于深入理解与BCR-ABL致癌过程相关的分子机制和通路。除上述样本构成与表达谱信息外，源站未提供更细化的数据文件结构、基因数量或表达矩阵格式说明。
【采集与来源】
样本来源于MRC UKALLXII/ECOG E2993组间研究中的成人ALL标本。基因表达谱检测使用3DNA Array 900 Expression Array Detection Kit（Genisphere，Hatfield，PA），并按照制造商说明进行操作。参考RNA为Universal Human Reference RNA（Stratagene，La Jolla，CA）。数据集来源站为omicsdi.org。以上为源站提供的采集与实验来源信息，关于样本采集时间、临床随访信息及伦理审批等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于成人急性淋巴细胞白血病的转录组层面研究，尤其是BCR-ABL阳性与阴性样本的基因表达比较分析，以及p185与p210亚型之间的表达特征差异探索。可用于研究与BCR-ABL致癌机制相关的分子机制和通路，也可作为白血病分子分型、生物标志物筛选和机制假设生成的数据资源。由于数据聚焦于成人ALL且样本具有明确的BCR-ABL状态与亚型标注，适合用于融合基因相关表达模式的分析。具体分析场景的适用范围需结合数据实际质量与设计加以判断，源站未提供更多适用性说明。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法及分析工具建议等。使用者需依据源站omicsdi.org的公开信息自行获取数据，并结合基因表达谱研究的通用流程进行质量控制、归一化和差异表达分析。由于源站未提供详细的使用指南，建议在使用前确认数据版本与样本标注的一致性。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应或技术重复的说明。该数据集样本量为54例，其中BCR-ABL阳性37例、阴性17例，阳性样本内部p185与p210亚型分别为21例和16例，样本分组相对明确，但源站未提供临床变量、随访信息或验证队列信息。使用时应考虑样本来源为特定组间研究，其代表性及外推能力需结合研究设计判断。源站未提供许可与引用信息。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款。使用该数据集时，应参考来源站omicsdi.org及原始研究MRC UKALLXII/ECOG E2993的相关发布信息，具体引用格式与使用许可需以源站说明为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-SMDB-3750
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
一组37例BCR-ABL阳性（其中分别有21例和16例表达p185和p210）和17例BCR-ABL阴性的成人ALL标本，来自MRC UKALLXII/ECOG E2993组间研究。使用3DNA Array 900 Expression Array Detection Kit（Genisphere，Hatfield，PA）按照制造商说明进行基因表达谱分析。使用Universal Human Reference RNA（Stratagene，La Jolla，CA）作为参考RNA。这些结果为了解与BCR-ABL致癌相关的分子机制和通路提供了见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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