人AML FAB-M0样本转录谱分析

研究通过表达谱分析35例AML-M0与253例已报道AML病例,探讨AML-M0是否构成独特的分子亚群。结果显示AML-M0具有独特表达特征,CEBPA、CEBPD、PU.1、ETV6及MPO等基因显著下调,并与未成熟AML亚群高度正相关

biostudies
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基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Transcription profiling of human AML FAB-M0 samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

人AML FAB-M0样本转录谱分析

Transcription profiling of human AML FAB-M0 samples

该数据集来自ebi.ac.uk,为Ficoll分离的人AML-M0样本在Affymetrix HGU133Plus2.0 GeneChip上的基因表达谱。研究通过表达谱分析35例AML-M0与253例已报道AML病例,探讨AML-M0是否构成独特的分子亚群。结果显示AML-M0具有独特表达特征,CEBPA、CEBPD、PU.1、ETV6及MPO等基因显著下调,并与未成熟AML亚群高度正相关。可用于白血病分子分型、亚群判别及差异表达研究(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Ficoll分离的AML-M0样本在Affymetrix HGU133Plus2.0 GeneChip上的基因表达谱。急性髓系白血病(AML)中分类为FAB-M0的亚型定义为形态学上最低分化的亚型。在此,我们通过基因表达(GEP)谱分析研究了AML-M0病例是否应被视为一个或多个独特的分子亚群,以将其与其他AML患者区分开来。通过应用GEP并对35例AML-M0样本和253例先前报道的AML病例进行后续无监督分析,我们证明AML-M0病例表达一种独特的特征。血液学转录调控因子如CEBPA、CEBPD、PU.1和ETV6以及分化相关基因MPO出现强烈下调,这与该类白血病非常原始的状态一致。此外,AML-M0病例似乎与先前定义的未成熟AML亚群具有强正相关。

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-17061

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

白血病。此外,AML M0病例似乎与先前定义的一个预后不良的未成熟AML亚组呈强烈正相关。AML-M0白血病常携带功能丧失的RUNX-1突变,无监督分析揭示了病例之间显著的差异。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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