人类急性髓系白血病患者转录谱分析

该数据集来自ebi.ac.uk,为人类急性髓系白血病(AML)患者的转录谱分析数据,属于肿瘤/白血病分类。研究聚焦携带11q扩增(涉及MLL基因位点)的AML/MDS患者,这类患者发病较晚、核型复杂且预后极差

biostudies
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基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Transcription profiling of human acute myeloid leukemia patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

人类急性髓系白血病患者转录谱分析

Transcription profiling of human acute myeloid leukemia patients

该数据集来自ebi.ac.uk,为人类急性髓系白血病(AML)患者的转录谱分析数据,属于肿瘤/白血病分类。研究聚焦携带11q扩增(涉及MLL基因位点)的AML/MDS患者,这类患者发病较晚、核型复杂且预后极差。数据涵盖19例AML/MDS伴MLL增益/扩增患者,其中12例进行了array CGH(GSE9928),用于界定5q、17p、7q的最小缺失区域并识别三个独立扩增区域11q/I-III。该数据可用于研究MLL扩增相关基因表达变化及AML/MDS分子机制(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):携带涉及混合谱系白血病基因(MLL)位点的11q扩增的AML/MDS患者,其特征为发病较晚、复杂异常核型(CAK)常包括5q、17p和7q内的缺失,以及疾病快速进展且预后极差。我们和其他人已表明,MLL基因在扩增病例中过表达,然而在大多数病例中,扩增区域并不局限于MLL位点。在本研究中,我们调查了19例伴有MLL增益/扩增的AML/MDS患者[15例AML(两例继发性,分别继发于MDS和PV,以及三例治疗相关)和4例MDS病例(两例治疗相关)]。通过对12例患者(GSE9928)进行array CGH,我们能够描绘5q、17p和7q内的最小缺失区域,并识别出在所有病例中均扩增的三个独立区域11q/I-III。基因表达

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-10258

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

; diagnosis: AML; age: 69; sex: f; tissue: BM acute myeloid leukemia; lab code: P55; diagnosis: AML M5; age: 71; sex: m; tissue: BM … 12 other values Array assay RNA assay GSE10258GSM259101 Raw Data GSE10258GSM259100 IDF File tab-delimited text Investigation Design Format (IDF) SDRF File Sample and Data

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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