人类急性髓系白血病干细胞转录谱分析揭示失调基因网络

该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组表达谱分析。研究首次对高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者的白血病干细胞(LSC)进行全基因组表达谱直接比较,鉴定出 3,005 个差异表达基因,并通过两种独立分析发现 LSC 中多条通路异常调控,包括

biostudies
浏览 10
时间序列分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Transcription profiling of human acute myelogenous leukemia stem cells reveals disregulated gene networks

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

人类急性髓系白血病干细胞转录谱分析揭示失调基因网络

Transcription profiling of human acute myelogenous leukemia stem cells reveals disregulated gene networks

该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组表达谱分析。研究首次对高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者的白血病干细胞(LSC)进行全基因组表达谱直接比较,鉴定出 3,005 个差异表达基因,并通过两种独立分析发现 LSC 中多条通路异常调控,包括 Wnt 信号、MAP Kinase 信号、黏附连接、核糖体和 T 细胞受体信号通路。数据可用于白血病干细胞相关基因网络与通路研究(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们进行了首个全基因组表达分析,直接比较高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者白血病干细胞(LSC)的表达谱。将正常 HSC 的表达特征与 LSC 进行比较,我们鉴定出 3,005 个差异表达基因。通过 2 种独立分析,我们鉴定出多条在白血病干细胞中相对于正常 HSC 异常调控的通路。若干通路,包括 Wnt 信号、MAP Kinase 信号和 Adherens Junction,因其在癌症发生和干细胞生物学中的作用而广为人知。其他通路此前未被认为与癌症干细胞功能调控相关,包括 Ribosome 和 T Cell Receptor Signaling 通路。本研究表明,将全局基因表达分析与详细

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-17054

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-17054

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-17054 人类急性髓系白血病干细胞的转录谱分析揭示了失调的基因网络,通过微阵列进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 人类 我们进行了首次全基因组表达分析,直接比较了高度富集的

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。