人类急性髓系白血病干细胞转录谱分析揭示失调基因网络
该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组表达谱分析。研究首次对高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者的白血病干细胞(LSC)进行全基因组表达谱直接比较,鉴定出 3,005 个差异表达基因,并通过两种独立分析发现 LSC 中多条通路异常调控,包括

基本信息
资源简介
人类急性髓系白血病干细胞转录谱分析揭示失调基因网络
Transcription profiling of human acute myelogenous leukemia stem cells reveals disregulated gene networks
该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,主题为转录组表达谱分析。研究首次对高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者的白血病干细胞(LSC)进行全基因组表达谱直接比较,鉴定出 3,005 个差异表达基因,并通过两种独立分析发现 LSC 中多条通路异常调控,包括 Wnt 信号、MAP Kinase 信号、黏附连接、核糖体和 T 细胞受体信号通路。数据可用于白血病干细胞相关基因网络与通路研究(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们进行了首个全基因组表达分析,直接比较高度富集的正常人造血干细胞(HSC)与急性髓系白血病(AML)患者白血病干细胞(LSC)的表达谱。将正常 HSC 的表达特征与 LSC 进行比较,我们鉴定出 3,005 个差异表达基因。通过 2 种独立分析,我们鉴定出多条在白血病干细胞中相对于正常 HSC 异常调控的通路。若干通路,包括 Wnt 信号、MAP Kinase 信号和 Adherens Junction,因其在癌症发生和干细胞生物学中的作用而广为人知。其他通路此前未被认为与癌症干细胞功能调控相关,包括 Ribosome 和 T Cell Receptor Signaling 通路。本研究表明,将全局基因表达分析与详细
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-17054
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-17054
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-17054 人类急性髓系白血病干细胞的转录谱分析揭示了失调的基因网络,通过微阵列进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 人类 我们进行了首次全基因组表达分析,直接比较了高度富集的
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




