用于诊断目的的人类急性淋巴细胞白血病样本转录谱分析
该数据集来自 ebi.ac.uk，为人类急性淋巴细胞白血病样本的转录谱分析数据，主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens
基本信息
资源简介
用于诊断目的的人类急性淋巴细胞白血病样本转录谱分析
Transcription profiling of human acute lymphoblastic leukemia samples for diagnostic purposes
该数据集来自 ebi.ac.uk，为人类急性淋巴细胞白血病样本的转录谱分析数据，主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens。源站描述涉及高危儿童 B 前体 ALL 队列的基因表达谱、单核苷酸多态性微阵列与候选基因重测序研究，并包含拷贝数异常分类器的构建与验证。数据可用于白血病分子分型、预后相关特征识别及分类模型研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们研究了一个由221例高危儿童B前体ALL患者组成的队列，该队列排除了已知的高危ALL亚型（BCR-ABL1和婴儿ALL），使用Affymetrix单核苷酸多态性微阵列、基因表达谱分析和候选基因重测序。使用半监督主成分方法识别出一个CNA不良预后预测因子，并在一个由258例儿童B前体ALL病例组成的独立验证队列中进行了测试。超过50个反复体细胞获得的CNA区域，其中最常靶向的基因编码B淋巴发育的调节因子（占病例的66.8%；其中PAX5靶向占31.7%，IKZF1占28.6%）。一个CNA分类器在高危队列中识别出一个预后极差的亚组（P=4.2x10-5），并与涉及IKZF1的缺失存在强烈关联，IKZF1编码早期淋巴转录因子IKAROS。该分类
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-12995
下载信息
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数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-12995
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Guangchun Song (2008). Transcription profiling of human acute lymphoblastic leukemia samples for diagnostic purposes [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-12995
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