TARGET:急性淋巴细胞白血病(ALL)扩展期第2阶段
该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的全基因组DNA甲基化数据,样本为诊断时采集的骨髓或外周血。该数据可用于儿童ALL分子亚型的表观遗传学特征分析与机器学习分类研究(来源 figshare,Restricted Access 许可)

基本信息
资源简介
TARGET:急性淋巴细胞白血病(ALL)扩展期第2阶段
Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia
该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的全基因组DNA甲基化数据,样本为诊断时采集的骨髓或外周血。数据基于Illumina Infinium HumanMethylation450k Beadchip芯片生成,元数据记录涉及原始idat文件。该数据可用于儿童ALL分子亚型的表观遗传学特征分析与机器学习分类研究(来源 figshare,Restricted Access 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia》发表于 npj Precision Oncology(2023),DOI:10.1038/s41698-023-00479-5。项目资助方:The Swedish Cancer Society (#CAN2018-623, #CAN2022-2395)。源站首次发布:2024-01-10。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)样本的全基因组DNA甲基化数据,样本来源于ALL诊断时采集的骨髓或外周血(n = 384)。有关样本的更多详细信息见Krali等人2023年的补充表S2( ng亚硫酸氢盐转化的DNA扩增、片段化,并使用Illumina标准方案(iScan SQ仪器)杂交到Illumina Infinium Human Methylation450k Beadchip芯片上。该元数据记录包含由Infinium DNA甲基化芯片生成的原始idat文件的信息。原始idat文件使用Genome中的Methylation Module(1.8.5)软件处理
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.17044/scilifelab.22303531.v3。
【主题与分类】
源站学科分类:Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。主题标签:Epigenetics、DNA methylation、Illumina 450k arrays、Machine Learning、Machine Learning (ML)、Cancer。本站分类:肿瘤/白血病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Multimodal_classification_of_molecular_subtypes_in_pediatric_acute_lymphoblastic_leukemia/22303531
使用许可:Restricted Access(https://www.scilifelab.se/data/restricted-access/)。
规范引用:Krali, Olga; Marincevic-Zuniga, Yanara; Arvidsson, Gustav; Enblad, Anna Pia; Lundmark, Anders; Sayyab, Shumaila; et al. (2023). Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Uppsala University. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-15,引用时请注意版本时效。
下载信息
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- OpenDataLab:
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