TARGET:急性淋巴细胞白血病(ALL)扩展期第2阶段

该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的全基因组DNA甲基化数据,样本为诊断时采集的骨髓或外周血。该数据可用于儿童ALL分子亚型的表观遗传学特征分析与机器学习分类研究(来源 figshare,Restricted Access 许可)

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2025-01-15 更新
浏览 3
医学影像分类EpigeneticsDNA methylationIllumina 450k arraysMachine LearningMachine Learning (ML)Cancer
TARGET: Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) Expansion Phase 2

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
许可
Restricted Access
创建/更新时间
2025-01-15
版本
v3

资源简介

TARGET:急性淋巴细胞白血病(ALL)扩展期第2阶段

Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia

该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的全基因组DNA甲基化数据,样本为诊断时采集的骨髓或外周血。数据基于Illumina Infinium HumanMethylation450k Beadchip芯片生成,元数据记录涉及原始idat文件。该数据可用于儿童ALL分子亚型的表观遗传学特征分析与机器学习分类研究(来源 figshare,Restricted Access 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia》发表于 npj Precision Oncology(2023),DOI:10.1038/s41698-023-00479-5。项目资助方:The Swedish Cancer Society (#CAN2018-623, #CAN2022-2395)。源站首次发布:2024-01-10。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自384例儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)样本的全基因组DNA甲基化数据,样本来源于ALL诊断时采集的骨髓或外周血(n = 384)。有关样本的更多详细信息见Krali等人2023年的补充表S2( ng亚硫酸氢盐转化的DNA扩增、片段化,并使用Illumina标准方案(iScan SQ仪器)杂交到Illumina Infinium Human Methylation450k Beadchip芯片上。该元数据记录包含由Infinium DNA甲基化芯片生成的原始idat文件的信息。原始idat文件使用Genome中的Methylation Module(1.8.5)软件处理

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.17044/scilifelab.22303531.v3。

【主题与分类】

源站学科分类:Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。主题标签:Epigenetics、DNA methylation、Illumina 450k arrays、Machine Learning、Machine Learning (ML)、Cancer。本站分类:肿瘤/白血病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Epigenetics (incl. genome methylation and epigenomics)、Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Multimodal_classification_of_molecular_subtypes_in_pediatric_acute_lymphoblastic_leukemia/22303531

使用许可:Restricted Access(https://www.scilifelab.se/data/restricted-access/)。

规范引用:Krali, Olga; Marincevic-Zuniga, Yanara; Arvidsson, Gustav; Enblad, Anna Pia; Lundmark, Anders; Sayyab, Shumaila; et al. (2023). Multimodal classification of molecular subtypes in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Uppsala University. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-01-15,引用时请注意版本时效。

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