慢性髓性白血病免疫细胞应答的单细胞图谱
该数据集来自慢性髓性白血病（CML）患者，包含TKI停药前后的样本，采用配对单细胞RNA与T细胞受体αβ链测序（scRNA+TCRαβ-seq）技术，用于研究CML中的固有免疫和适应性免疫应答
基本信息
资源简介
慢性髓性白血病免疫细胞应答的单细胞图谱
该数据集聚焦于慢性髓性白血病（CML）中免疫细胞应答的单细胞图谱构建，来源于omicsdi.org，归类于肿瘤／白血病方向，主题标签为基因组学。其核心价值在于以单细胞分辨率同时捕获转录组信息与T细胞受体αβ链序列，从而在CML这一特定白血病背景下观察固有免疫与适应性免疫的动态变化。数据集特别关注酪氨酸激酶抑制剂（TKI）停药前后的样本，为理解停药后免疫状态的重塑提供了直接的单细胞层面素材。整体而言，该数据集以CML患者为对象，结合配对单细胞RNA测序与TCRαβ链测序技术，构成了一份可用于免疫应答机制探索的单细胞资源。
【数据集背景】
慢性髓性白血病是一种以髓系细胞异常增殖为特征的血液肿瘤。TKI（如伊马替尼）的应用显著改变了CML的治疗格局，但停药后的免疫应答变化仍是值得深入研究的环节。该数据集正是围绕CML患者中固有免疫和适应性免疫应答这一目标而生成，通过单细胞层面的配对测序，试图刻画诊断时以及TKI停药前后的免疫细胞组成与T细胞受体克隆特征。源站描述指出，研究还将CML数据与不同癌症以及健康供体进行了比较，以提供更广的参照背景。
【数据内容】
该数据集包含来自CML患者的25个样本。其中，诊断时样本涉及7名受试者（若样本数与受试者数不同，则样本数为9）；TKI停药前后样本涉及6名受试者（样本数为15），这些样本来自伊马替尼停药前后。所有样本均采用配对单细胞RNA与T细胞受体αβ链测序（scRNA+TCRαβ-seq）进行 profiling。需要说明的是，该数据集本身仅包含TKI停药前后的样本；与诊断时样本、其他癌症样本以及健康供体样本相关的信息，源站描述提示需参见相应手稿。主题标签为基因组学。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。源站描述提及，为研究CML中的固有免疫和适应性免疫应答，对CML患者样本进行了单细胞RNA与TCRαβ链的配对测序。样本涵盖诊断时以及伊马替尼TKI停药前后两个阶段。比较队列包括不同癌症（n=29）和健康供体（n=7），但这些比较数据是否包含在本数据集中，源站未提供明确说明，仅指出该数据集包含的是TKI停药前后的样本，其他数据集信息需参见手稿。
【适用场景】
该数据集适用于在单细胞水平上研究CML患者TKI停药前后的免疫细胞应答，尤其是T细胞受体克隆型与转录状态的联合分析。由于同时捕获RNA与TCRαβ链信息，可用于探索适应性免疫中T细胞克隆扩增、克隆型多样性以及固有免疫细胞亚群的变化。此外，源站描述提到与不同癌症及健康供体的比较，提示该数据集也可作为CML免疫特征与其它疾病或健康状态对照分析的组成部分。主题标签“基因组学”表明其适用于基因组学相关分析场景。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、文件格式、预处理流程、分析工具或代码等均未在现有信息中给出。使用者需参考源站或相关手稿获取进一步的操作指引。
【质量与限制】
该数据集仅包含TKI停药前后的样本，诊断时样本、其他癌症样本及健康供体样本的信息需参见手稿，因此本数据集本身并不完整覆盖源站描述中提及的全部比较队列。此外，源站未提供关于测序深度、细胞数量、数据质控标准、批次效应处理或技术验证等质量相关信息。样本量方面，TKI停药前后涉及6名受试者、15个样本，诊断时涉及7名受试者、9个样本（若样本数与受试者数不同），这些数字来源于源站描述，但未提供更详细的临床或技术元数据。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可协议或数据使用条款等相关信息。使用者应自行查阅omicsdi.org源站页面或相关手稿以获取引用与许可要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005044
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
To study the innate and adaptive immune responses in CML, we profiled 25 samples from CML patients including samples at diagnosis (n = 7, N = 9, where n is the number of subjects and N the number of samples if different from n) and before and after TKI-cessation with imatinib (n = 6, N = 15) with paired single-cell RNA and T cell receptor (TCR) αβ chain sequencing (scRNA+TCRαβ-seq) and compared our data to different cancers (n = 29) and healthy donors (n = 7). This dataset contains the samples from before and after TKI-cessation, please see the manuscript for info related to the other datasets.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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