B细胞前体急性淋巴细胞白血病诊断时的单细胞发育分类揭示复发预测因子

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae9ee815841d91f9ba8a5c0d9c09562d288931a3e288cc548f13d9d610032b56b

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集支持发表于《Nature Medicine》（2018年）的论文《Single-Cell Developmental Classification of B-Cell Precursor Acute Lymphoblastic Leukemia at Diagnosis Reveals Predictors of Relapse》。数据集包含60名确诊为B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）的儿科患者的单细胞质谱流式细胞术测量数据，以及5名健康骨髓供者的数据。研究使用包含35种表面蛋白和胞内蛋白的检测 panel，通过监督式单细胞发育分类器将每个白血病细胞归类至其最接近的B细胞发育阶段。基于这些分类细胞群体所衍生的特征——包括基础条件和扰动条件下的蛋白表达水平及信号响应——构建了机器学习模型（发育依赖性复发预测器，DDPR），用于在诊断时根据未来复发风险对患者进行分层。该数据集包含原始的、经微珠归一化的离子计数数据。

它使得探索……，# 诊断时B细胞前体急性淋巴细胞白血病的单细胞发育分类可揭示复发预测因素 数据集DOI：10.5061/dryad.pvmcvdnxc ## 数据和文件结构说明 # DDPR 发育依赖性复发预测因子 该存储库包含为DDPR项目生成的原始质谱流式（.FCS）数据，如以下文献所述：Good等，诊断时B细胞前体急性淋巴细胞白血病的单细胞发育分类可揭示复发预测因素，Nature Medicine，2018年。 — ## 概述 该数据集由来自60例儿童B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）诊断样本和5名健康成人骨髓供者的单细胞质谱流式（CyTOF）数据组成。该研究使用了35标志物抗体组合，在单细胞分辨率下分析表面和细胞内蛋白表达谱，包括基线和扰动信号状态。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。