人MLL细胞shRNA图谱揭示HOXA9在MLL重排急性白血病生存中的必需性

数据围绕MLL重排急性白血病中HOXA9的作用展开,通过shRNA抑制HOXA9后进行基因表达谱分析,发现HOXA10、MEIS1、PBX3和MEF2C等基因协同下调

biostudies
浏览 15
基因组分类RNAi profiling by arrayHomo sapiens
shRNA profiling of human MLL cells reveals HOXA9 is required for survival in human MLL rearranged acute leukemias

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

人MLL细胞shRNA图谱揭示HOXA9在MLL重排急性白血病生存中的必需性

shRNA profiling of human MLL cells reveals HOXA9 is required for survival in human MLL rearranged acute leukemias

该数据集来自ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,采用RNAi profiling by array技术,研究对象为Homo sapiens。数据围绕MLL重排急性白血病中HOXA9的作用展开,通过shRNA抑制HOXA9后进行基因表达谱分析,发现HOXA10、MEIS1、PBX3和MEF2C等基因协同下调。该数据可用于研究HOXA9在MLL重排白血病中的功能机制,并探索以HOXA9或其下游程序为靶点的治疗策略(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):携带混合谱系白血病基因(MLL)易位的白血病具有独特的生物学特征,且通常预后不良。基因表达分析显示,MLL重排白血病具有独特的表达谱,包括HOXA9在内的部分Homeobox基因持续高水平表达。在此,我们利用RNAi研究了在MLL重排和MLL胚系白血病中抑制HOXA9的效果。抑制HOXA9后的基因表达谱分析显示,一个在人MLL-AML(本研究)和鼠MLL白血病(Krivtsov等,2006)干细胞中高表达的program被协同下调,包括HOXA10、MEIS1、PBX3和MEF2C。我们的数据表明HOXA9在人MLL重排白血病中具有重要作用,并提示靶向HOXA9或下游program可能是一种新的治疗选择。实验总体设计:RNA被纯化

【主题与分类】

主题标签:RNAi profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-13714

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-13714

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-13714 对人类 MLL 细胞的 shRNA 分析显示,HOXA9 是人类 MLL 重排急性白血病生存所必需的。通过芯片进行的 RNAi 分析。EFO EFO_0001030 人类。携带涉及混合谱系白血病基因(MLL)易位的白血病具有独特的生物学特征。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。