人外周血分离及CRISPR/Cas9介导BCL11B敲除的αβ CD8+ T细胞及未转染和mock对照的RNA-seq

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/白血病分类下的转录组学数据。数据涵盖从健康供体外周血分离的αβ CD8+ T细胞,经CRISPR/Cas9介导BCL11B敲除,并包含未转染(nt)和mock(mock gRNA转染)对照

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基因组分类Transcriptomics
RNA-seq from human peripheral blood isolated and CRISPR/Cas9-mediated BCL11B depleted alpha-beta CD8+ T cells and corresponding not transfected (nt) and mock (mock gRNA transfected) controls.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

人外周血分离及CRISPR/Cas9介导BCL11B敲除的αβ CD8+ T细胞及未转染和mock对照的RNA-seq

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/白血病分类下的转录组学数据。数据涵盖从健康供体外周血分离的αβ CD8+ T细胞,经CRISPR/Cas9介导BCL11B敲除,并包含未转染(nt)和mock(mock gRNA转染)对照。源站描述指出BCL11B是胸腺后淋巴细胞及淋巴细胞分化的重要调控因子,通过抑制NK细胞、促进T细胞发育,被视为T细胞命运的“守护者”。该数据可用于研究BCL11B在T细胞与NK细胞特征调控中的作用,以及为细胞治疗相关研究提供转录组层面的参考(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):B细胞淋巴瘤/白血病(BCL)11B是胸腺后淋巴细胞重要生命过程以及淋巴细胞分化的主要调控因子,它通过阻断NK细胞并促进T细胞发育,因此被认为是“T细胞命运的守护者”。有趣的是,一方面,NK细胞成熟与BCL11B表达增加相关;另一方面,具有多种NK细胞特征的天然或诱导性T细胞群体显示BCL11B表达降低。NK细胞或T细胞均显示出细胞疗法所需的独特且理想的特征。NK细胞能够有效裂解癌变或病毒感染细胞,但在体外只能有限扩增。相反,T细胞细胞毒性活性受T细胞受体(TCR)限制,但体外扩增容易实现。我们展示,从健康供体的血沉棕黄层中分离并经CRISPR/Cas9介导BCL11B

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12064

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

B细胞淋巴瘤/白血病(BCL)11B是胸腺后淋巴细胞重要生命过程的主要调控因子,也通过抑制NK细胞、促进T细胞发育来调控淋巴细胞分化,因此被视为“T细胞命运的守护者”。有趣的是,一方面NK细胞成熟与BCL11B表达增加相关,另一方面具有多种NK细胞特征的天然或诱导性T细胞群体则显示BCL11B表达降低。NK细胞和T细胞均展现出适用于细胞治疗的独特且理想的特征。NK细胞能够有效裂解癌变或病毒感染细胞,但在体外难以大量扩增。相比之下,T细胞的细胞毒性活性受T细胞受体(TCR)限制,但在体外易于扩增。我们发现,从健康供者血沉棕黄层中分离并经CRISPR/Cas9介导的BCL11B敲除的CD8+ T细胞,在IL-15刺激下获得了显著的先天免疫特征,并将自发性和抗体依赖性NK细胞细胞毒性,与T细胞快速体外扩增的能力结合在一起。

诱导性先天CD8+(iiT8)细胞的观察特征使其成为细胞治疗中一种有趣且有前景的工具。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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