NSG小鼠患者来源异种移植物的RNA-seq表达分析--Dana-Farber癌症研究所血液肿瘤
该数据集来自ebi.ac.uk,提供由The Jackson Laboratory分发的癌症模型的基因表达快照,属于肿瘤/白血病分类

基本信息
资源简介
NSG小鼠患者来源异种移植物的RNA-seq表达分析--Dana-Farber癌症研究所血液肿瘤
该数据集为 RNA-seq expression analysis of patient-derived xenografts in NSG mice--Dana-Farber Cancer Institute blood cancers,来源于 ebi.ac.uk,归类于肿瘤 / 白血病方向。其核心用途是提供由 The Jackson Laboratory 分发的癌症模型的基因表达快照,采用高通量测序对人类编码 RNA 进行 RNA-seq 分析,物种标注为 Homo sapiens。数据集名称表明其研究对象为 NSG 小鼠体内患者来源异种移植瘤(PDX)的 RNA 测序表达分析,并聚焦于 Dana-Farber Cancer Institute 的血液系统肿瘤。整体而言,该资源面向肿瘤与白血病研究场景,以测序数据形式记录癌症模型的转录组表达信息,便于研究者了解相关模型的基因表达状况。
【数据集背景】
该数据集来自 ebi.ac.uk,主题标签涵盖 Human - High-throughput sequencing、RNA-seq of coding RNA 与 Homo sapiens。其建立目的在源站描述中表述为:提供由 The Jackson Laboratory 分发的癌症模型的基因表达快照。数据集名称进一步指明其研究对象为 NSG 小鼠中患者来源异种移植瘤的 RNA 测序表达分析,并关联 Dana-Farber Cancer Institute 的血液系统肿瘤。本站将其归入肿瘤 / 白血病分类,说明其应用背景集中在肿瘤学与白血病研究领域。
【数据内容】
数据集内容为 RNA-seq 表达分析数据,属于编码 RNA 的高通量测序,物种标注为 Homo sapiens。数据围绕 NSG 小鼠体内患者来源异种移植瘤模型展开,涉及 Dana-Farber Cancer Institute 的血液系统肿瘤。源站描述强调其提供的是癌症模型的基因表达快照,即对相关模型基因表达状况的阶段性记录。关于样本数量、测序平台、读长、表达定量矩阵的具体构成等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。源站描述说明,其面向由 The Jackson Laboratory 分发的癌症模型提供基因表达快照。数据集名称表明分析对象为 NSG 小鼠中患者来源的异种移植瘤,并涉及 Dana-Farber Cancer Institute 的血液系统肿瘤。关于样本采集流程、建库方法、测序仪器与数据处理流程等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于需要了解由 The Jackson Laboratory 分发的癌症模型基因表达状况的研究场景,尤其是围绕 NSG 小鼠患者来源异种移植瘤模型、聚焦血液系统肿瘤的转录组表达分析。其“基因表达快照”的定位,可用于对相关癌症模型的表达特征进行初步了解与比较。关于具体可支持的分析类型与验证用途,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、分析流程与配套工具等。使用者需依据 ebi.ac.uk 的通用数据访问机制自行获取与处理数据。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次效应、样本量、覆盖度或技术偏差等信息。该数据集被描述为基因表达快照,其覆盖范围与更新情况源站未提供。使用时应结合具体研究目的谨慎解读。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款信息。使用该数据集时,应遵循 ebi.ac.uk 的相关数据使用政策,具体引用要求与许可条件需另行确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-9176
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
year 59 year … 6 other values male female bone marrow other lymph node Not Reported White Black Hispanic NULL blood acute lymphocytic leukemia mature T-cell and NK-cell lymphoma acute leukemia B-cell lymphoma T-cell adult acute lymphocytic leukemia B-cell adult acute lymphocytic leukemia diffuse
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




