MLL-r 白血病启动子高甲基化：生物学与治疗靶向

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-19671

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数据说明

MLL-r婴儿急性淋巴细胞白血病(ALL)的发病机制在很大程度上尚不清楚。已有研究表明，其与拷贝数变化或酪氨酸激酶组突变无关。因此，我们探索了全基因组CpG岛高甲基化在MLL-r婴儿ALL中的可能作用。我们采用HELP(HpaII-微小片段连接介导PCR富集)检测法检测了MLL-r婴儿白血病样本(n=5)、其他常见儿童ALL样本(n=5)和正常样本(n=5)。随后我们研究了5-氮杂-2’-脱氧胞苷(地西他滨)的生物学相关性及治疗潜力。HELP检测分析显示，样本紧密聚集于各自的生物学分组中，且MLL-r婴儿白血病整体上相对呈高甲基化状态。此外，从HELP检测中选取进行分析的大多数基因处于沉默或低表达状态。MLL-r细胞系在地西他滨处理后呈现剂量和时间依赖性的细胞杀伤效应，且大多数下调基因的表达出现回升。这在MLL-wt细胞系中未见。对于重新表达的基因，甲基化特异性PCR证实了MLL-r样本中启动子优先发生甲基化。

综上所述，这表明甲基化特征在儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）中具有独特性，启动子高甲基化可能在MLL-r婴儿白血病发生中发挥重要作用，且这一现象可被逆转，去甲基化药物或可成为婴儿白血病潜在的新治疗选择。关键词：DNA甲基化谱分析 对5例MLL-r ALL婴儿、5例其他常见类型ALL患儿以及5例正常样本（包括CD34+精选脐血细胞n=3和CD19+精选脐血细胞n=2）的白血病原始细胞中DNA甲基化进行直接比较

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。