PRJNA942249:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢与化疗耐药 [ChIP-seq]

该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA942249),主题为急性髓系白血病(AML)发展中核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译重编程琥珀酸代谢及化疗耐药,包含 ChIP-seq 数据

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基因组分类Epigenomics
PRJNA942249: Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance.[ChIP-seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA942249:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢与化疗耐药 [ChIP-seq]

PRJNA942249 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录,其完整英文名称为“Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance.[ChIP-seq]”。该数据集在分类上归属于肿瘤/白血病领域,主题标签为表观基因组学(Epigenomics),核心数据类型为 ChIP-seq。从标题可以看出,该项目聚焦于急性髓系白血病(AML)发生发展及化疗耐药过程中,核编码线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢这一生物学问题。BioProject 作为生物数据的集合性记录,将同一项研究计划下产生的多种数据类型汇聚于单一入口,便于用户集中查找与访问。该记录为研究者了解该 AML 相关表观基因组学研究的数据构成提供了统一入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA942249。BioProject 是围绕单一研究计划、由单一机构或联合体发起的一组生物数据的集合,其记录为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一位置。本项目的研究主题为急性髓系白血病(AML)的发展与化疗耐药,具体关注核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译对琥珀酸代谢的重编程作用。该主题属于肿瘤学与白血病研究范畴,并带有表观基因组学标签,表明其数据与染色质层面的调控机制研究相关。源站标题以“Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance”概括了研究核心,并标注了 ChIP-seq 这一数据子类型。

【数据内容】

该数据集包含 ChIP-seq 数据,属于表观基因组学范畴。其英文名称中明确标注了“[ChIP-seq]”,说明该 BioProject 记录下汇集的是染色质免疫共沉淀测序相关的数据。项目整体围绕 AML 发展与化疗耐药中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译及琥珀酸代谢重编程这一研究问题展开。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、测序平台、具体靶蛋白、数据文件格式或数据量的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心(NCBI)的 BioProject 数据库。记录编号为 PRJNA942249,源站标题为“Selective translation of nuclear mitochondrial res... (ID 942249) - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 记录汇集了来自单一机构或联合体的、与单一研究计划相关的生物数据,并为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一入口。除来源站与编号外,源站未提供具体的采集方法、实验设计、样本来源机构或伦理审批等信息。

【适用场景】

基于其分类与主题标签,该数据集适用于肿瘤学、白血病特别是急性髓系白血病(AML)相关研究,以及表观基因组学与 ChIP-seq 数据分析等场景。对于关注 AML 发展机制、化疗耐药机制、线粒体呼吸蛋白翻译调控以及琥珀酸代谢重编程的研究者,该 BioProject 可作为查找相关 ChIP-seq 数据的入口。此外,由于 BioProject 本身是多种数据类型的集合入口,该记录也适合用于定位同一研究计划下的其他关联数据。源站未提供关于具体分析流程、推荐工具或下游应用案例的说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以编号 PRJNA942249 检索并访问该记录。BioProject 记录的设计目的是为用户提供单一位置,以便查找该项目所产生的多种数据类型。因此,使用者可借助该记录获取指向相关数据文件的链接,进而下载或进一步分析其中的 ChIP-seq 数据。源站未提供关于数据下载格式、访问权限、所需软件或具体操作步骤的说明。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject 这一公开生物数据资源,其记录形式为项目级集合。源站未提供关于数据质量评估、测序深度、重复性、批次效应或验证实验等信息。此外,源站未提供样本量、数据完整度或潜在偏倚等具体限制说明。使用者应注意,BioProject 记录本身是数据集合的索引性条目,具体数据质量需结合其关联的原始数据记录进行判断。源站未提供相关质量与限制的进一步内容。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用限制等信息。使用者如需引用或使用该数据集,应参考 NCBI BioProject 及关联数据记录中可能提供的相关说明。源站未提供具体许可与引用要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA942249

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此,我们鉴定出一种新型的RAS反应元件结合蛋白1短异构体RREB1S,它是调控线粒体复合体II翻译的关键因素,促进急性髓系白血病癌症干细胞的干性和耐药性。总体设计:本数据集包含从野生型或Rreb1敲除小鼠中分离出的白血病干细胞的输入和ChIP-seq实验。从骨髓中分离出白血病干细胞,进行ChIP-seq分析,并设有两个生物学重复。

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