PRJNA942248:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢与化疗耐药 [ATAC-seq]
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 942248),主题为急性髓系白血病(AML)发展中核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢并影响化疗耐药,包含 ATAC-seq 数据
![PRJNA942248: Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance.[ATAC-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/96881.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA942248:AML 发展中核线粒体呼吸蛋白选择性翻译重编程琥珀酸代谢与化疗耐药 [ATAC-seq]
PRJNA942248 是一个来自 NCBI BioProject 的公开数据集,其完整英文名称为“Selective translation of nuclear mitochondrial respiratory proteins reprograms succinate metabolism in AML development and chemoresistance.[ATAC-seq]”。该数据集聚焦于急性髓系白血病(AML)发生发展及化疗耐药过程中,核编码线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢这一生物学问题,并提供了相应的 ATAC-seq 数据。从主题标签看,该数据集归属于表观基因组学(Epigenomics)范畴,本站将其归类为肿瘤 / 白血病方向。该数据集为研究者理解 AML 中代谢与表观遗传调控之间的关联提供了可检索、可链接的数据资源入口。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 942248。BioProject 是 NCBI 提供的一种记录集合,用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物学数据。根据源站描述,一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体,其记录为用户提供一个统一的位置,以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集所对应的研究主题为急性髓系白血病(AML)发展中核线粒体呼吸蛋白的选择性翻译如何重编程琥珀酸代谢并影响化疗耐药。这一主题涉及白血病发生、代谢重编程以及化疗耐药等多个相互关联的生物学过程,属于肿瘤与表观基因组学交叉的研究方向。
【数据内容】
该数据集包含 ATAC-seq 数据,其英文名称中明确标注了“[ATAC-seq]”。ATAC-seq 是一种用于检测染色质开放性的测序方法,通常用于表观基因组学研究。该数据集的主题标签为“Epigenomics”,与 ATAC-seq 数据的表观遗传学属性一致。除 ATAC-seq 这一数据类型的标注外,源站未提供关于样本数量、测序深度、基因组版本、数据文件格式或具体数据量的进一步信息。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体记录为 NCBI BioProject(ID 942248)。源站标题显示为“Selective translation of nuclear mitochondrial res... (ID 942248) - BioProject - NCBI”。关于样本采集地点、采集时间、采集方法、实验设计细节、伦理审批信息以及具体的研究机构或作者信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与急性髓系白血病(AML)相关的表观基因组学研究,尤其是涉及染色质开放性、核线粒体呼吸蛋白选择性翻译、琥珀酸代谢重编程以及化疗耐药机制等方向的分析。由于该数据集标注为 ATAC-seq,其典型用途包括评估特定条件下染色质开放区域的变化,并与其他类型的数据(如转录组、代谢组等)联合分析,以探索表观遗传调控与代谢重编程之间的关系。该数据集也可作为 BioProject 记录,用于检索和链接同一项目下的其他数据类型。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定实验流程,源站未提供相关信息。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库以编号 942248 进行检索和访问。用户可通过 BioProject 记录获取该项目所链接的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或参数设置,源站未提供。使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关数据使用规范。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开的生物学数据记录。关于数据质量评估指标、测序质量、覆盖度、重复性、批次效应、样本量大小或潜在偏差等信息,源站未提供。该数据集仅标注了 ATAC-seq 数据类型,未提供其他实验验证或质量控制细节。使用者应结合源站记录及可能的原始文献自行评估数据适用性。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 的通用使用条款,并建议查阅该项目的原始发表文献以获取完整的引用信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA942248
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在此,我们鉴定出一种新型的RAS反应元件结合蛋白1短异构体RREB1S,它在调控线粒体复合体II的翻译中起关键作用,从而促进急性髓系白血病癌症干细胞的干性和耐药性。总体设计:本数据集包含从野生型或Rreb1基因敲除小鼠中分离出的白血病干细胞的ATAC-Seq实验。白血病干细胞从骨髓中分离出来,用于ATAC-seq分析,并进行了两次生物学重复。
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