Moz+/+与Moz-/- MOZ-TIF2 AML细胞中H3K9和H3K23乙酰化的全基因组定位
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/白血病分类下的表观基因组学数据,针对Moz+/+与Moz-/-的MOZ-TIF2急性髓系白血病(AML)细胞,开展H3K9和H3K23乙酰化的全基因组定位

基本信息
资源简介
Moz+/+与Moz-/- MOZ-TIF2 AML细胞中H3K9和H3K23乙酰化的全基因组定位
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/白血病分类下的表观基因组学数据,针对Moz+/+与Moz-/-的MOZ-TIF2急性髓系白血病(AML)细胞,开展H3K9和H3K23乙酰化的全基因组定位。数据可用于比较MOZ缺失对上述组蛋白乙酰化修饰基因组分布的影响,支撑MOZ在MOZ-TIF2融合诱导AML中作用机制的研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):单核细胞白血病锌指蛋白(MOZ)是一种MYST型乙酰转移酶,参与急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征中的染色体易位。MOZ已被确立为造血所必需;然而,MOZ在AML中的作用尚未被探讨。我们提出MOZ对于MOZ-TIF2融合诱导的AML发展至关重要。表达MOZ-TIF2的Moz缺陷造血干/祖细胞(HSPCs)可在体外形成集落,但不能在小鼠中诱导AML。相比之下,Moz对于HOXA9转导细胞的集落形成以及由HOXA9和MEIS1引起的AML发展并非必需,提示MOZ在MOZ/MLL融合诱导的AML中具有特异性需求。在Moz缺陷的MOZ-TIF2 AML细胞中,Meis1(而非Hoxa9)的表达降低。通过将Meis1引入Moz缺陷细胞,MOZ-TIF2诱导的AML发展得以挽救。
【主题与分类】
主题标签:Epigenomics。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA860935
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- OpenDataLab:
数据说明
单核细胞白血病锌指蛋白(MOZ)是一种MYST型乙酰转移酶,参与急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征中的染色体易位。MOZ已被确认为造血过程所必需;然而,MOZ在AML中的作用尚未被探讨。我们提出,MOZ对于由MOZ-TIF2融合基因诱导的AML发展至关重要。表达MOZ-TIF2的Moz缺陷型造血干/祖细胞(HSPCs)在体外能够形成集落,但无法在小鼠中诱导AML。相比之下,Moz对于HOXA9转导细胞的集落形成以及由HOXA9和MEIS1引起的AML发展并非必需,这提示MOZ在由MOZ/MLL融合基因诱导的AML中具有特异性需求。在Moz缺陷型MOZ-TIF2 AML细胞中,Meis1的表达降低,而Hoxa9的表达未降低。通过将Meis1导入携带MOZ-TIF2的Moz缺陷型细胞,可挽救由MOZ-TIF2诱导的AML发展。Meis1缺失损害了MOZ-TIF2介导的AML发展。在Moz缺陷型MOZ-TIF2 AML细胞中,Meis1基因座的活性组蛋白修饰也严重减少。
这些结果表明,内源性MOZ对于MOZ融合诱导的AML发展至关重要,并在靶基因位点维持活跃的染色质特征。总体设计:对Moz+/+和Moz-/- MOZ-TIF2 AML细胞中全基因组H3K9和H3K23乙酰化进行染色质免疫沉淀DNA测序(ChIP-Seq)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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