基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA686864：慢性淋巴细胞白血病线粒体突变的纵向单细胞动态

PRJNA686864 是一个收录于 NCBI BioProject 的生物学研究项目数据集，编号为 686864。该数据集围绕慢性淋巴细胞白血病展开，聚焦于线粒体突变在纵向单细胞层面上的动态变化。源站标题指出，这些线粒体突变的动态能够反映疾病的历史。数据集在分类上归属于肿瘤 / 白血病方向，主题标签为表观基因组学（Epigenomics）。整体而言，该数据集提供了一个与单一研究计划相关的生物数据集合入口，便于使用者从统一位置获取该项目所生成的多种数据类型，并了解其在慢性淋巴细胞白血病研究中的定位。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 686864。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，这些计划通常来自单一组织或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，用以查找为该项目生成的各类数据类型的链接。该数据集的主题为慢性淋巴细胞白血病中线粒体突变的纵向单细胞动态，源站标题进一步指出其可反映疾病历史。本站将其归类为肿瘤 / 白血病，主题标签为表观基因组学。

【数据内容】

该数据集的核心内容为慢性淋巴细胞白血病中线粒体突变的纵向单细胞动态。源站标题表明，这些动态能够镜像或反映疾病的历史。数据集涉及单细胞层面的分析，并关注线粒体突变随时间的纵向变化。主题标签为表观基因组学，提示该数据集与表观遗传或基因组层面的调控研究相关。关于具体的样本数量、突变位点、时间点数目、细胞数量等详细数据内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 686864。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，这些数据来自单一组织或联合体。该记录提供统一入口，链接到为该项目生成的多种数据类型。关于具体的采集地点、采集时间、采集方法、样本处理流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与慢性淋巴细胞白血病相关的线粒体突变研究，尤其是需要在纵向单细胞层面观察突变动态的场景。由于源站标题指出这些动态可反映疾病历史，该数据集可能适用于探索疾病进展、追溯疾病演化路径等研究方向。主题标签为表观基因组学，因此也可能适用于表观基因组学与线粒体突变交叉领域的研究。关于具体的适用分析类型、可回答的生物学问题等，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，项目编号为 686864。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，用以查找为该项目生成的各类数据类型的链接。使用者可依据该记录获取相关数据类型的入口。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、处理流程等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于围绕单一研究计划汇集的数据集合。关于数据质量指标、覆盖度、完整性、批次效应、技术偏差等具体质量信息，源站未提供。关于该数据集在样本量、时间跨度、细胞数目等方面的限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 686864。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制等，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163579

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA686864

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

线粒体突变有可能充当天然条形码，从而能够在单细胞水平上追踪异质性细胞群体，但迄今为止，线粒体突变在时间和组织区室中的动态变化尚未得到广泛研究。该数据集利用mtscATAC-seq生成，用于追踪9名慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者在不同临床情景下外周血、骨髓和淋巴结中的线粒体突变。我们的深入分析揭示了在接受观察等待、氟达拉滨、环磷酰胺和利妥昔单抗（FCR）化疗、异基因干细胞移植、依鲁替尼治疗或向里氏综合征转化的患者中，线粒体突变的不同动态模式。我们提供证据表明，线粒体突变可将CLL亚克隆与不同的染色质细胞状态联系起来。线粒体突变似乎能够重现CLL的疾病历史，在患者层面支持了将体内天然条形码作为理解癌症克隆动态手段的概念。

总体设计：从九名被诊断为慢性淋巴细胞白血病的人类患者中获取了外周血、骨髓和淋巴结中的单核细胞，并在10x平台上采用mtscATAC-seq技术进行了测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别