PRJNA432268：儿童组织细胞肉瘤及前驱血液恶性肿瘤的450K分析

资源简介

PRJNA432268：儿童组织细胞肉瘤及前驱血液恶性肿瘤的450K分析

PRJNA432268 是一个聚焦儿童组织细胞肉瘤及其前序血液系统恶性肿瘤的表观基因组学数据集，收录于 NCBI 站点。该数据集以 450K 芯片为技术手段，对 3 例组织细胞肉瘤及其对应白血病样本进行了分析，旨在从 DNA 甲基化层面刻画同一患者体内两种疾病之间的关联。数据集整体设计围绕“同一患者的组织细胞肉瘤与白血病”这一配对关系展开，属于肿瘤与白血病研究方向，主题标签为表观基因组学。对于关注儿童组织细胞肉瘤与血液系统恶性肿瘤关系的科研人员而言，该数据集提供了以 450K 阵列为基础的甲基化数据资源，可用于探索两类疾病在表观遗传层面的异同与潜在联系。

【数据集背景】

组织细胞肉瘤是一种较为罕见的肿瘤类型，而儿童患者中该疾病与血液系统恶性肿瘤之间的关系一直是临床与基础研究关注的问题。该数据集正是针对这一背景而建立，其英文名称明确指向“儿童组织细胞肉瘤及前序血液系统恶性肿瘤的 450K 分析”。从源站描述可知，数据集关注的是同一患者身上出现的组织细胞肉瘤与白血病，这种配对设计使得研究者能够在个体层面比较两种疾病状态下的甲基化特征。数据集所属分类为肿瘤 / 白血病，主题标签为表观基因组学，说明其研究视角落在表观遗传修饰层面，而非单纯的基因组序列变异。

【数据内容】

该数据集包含 3 例组织细胞肉瘤及其对应白血病的 450K array 数据。所谓 450K array，即基于 450K 芯片平台产生的 DNA 甲基化数据，属于表观基因组学研究的常用数据类型。数据覆盖的对象为组织细胞肉瘤样本与白血病样本，且二者来自同一患者，形成配对关系。源站描述中“Overall design: Histiocytic sarcoma and leukemia of the same patient”进一步说明了整体设计思路，即围绕同一患者的两种疾病状态组织数据。数据集未提供样本的具体数量、芯片位点数量、数据文件格式或单个样本的临床信息等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI 站点，属于公开可获取的生物医学数据资源。数据集的英文名称中包含 PRJNA432268 这一标识，表明其在 NCBI 体系下具有对应的项目编号。数据产生方式为 450K array 分析，研究对象为儿童组织细胞肉瘤及前序血液系统恶性肿瘤。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序或芯片实验的具体流程等，源站未提供。

【适用场景】

基于其数据内容与设计特点，该数据集适用于表观基因组学方向的探索性研究，尤其是围绕组织细胞肉瘤与白血病之间关系的甲基化分析。由于数据来自同一患者的配对样本，可用于比较两种疾病状态下的甲基化模式差异，也可作为儿童肿瘤与血液系统恶性肿瘤交叉研究的参考数据。此外，对于关注 450K 芯片数据在罕见肿瘤中应用的研究者，该数据集可作为方法学验证或初步分析的素材。需要说明的是，以上适用场景基于数据集的主题标签与设计描述进行的一般性说明，源站未提供具体的应用案例或分析结论。

【使用方法】

该数据集以 450K array 数据形式提供，使用者可按照 NCBI 站点上该类数据的常规获取方式进行下载与使用。由于数据集来自公开数据库，通常可结合相应的芯片分析流程进行甲基化数据预处理、质量控制与差异分析。关于数据的具体文件组织、下载格式、配套的分析工具或处理流程，源站未提供，使用者需依据 NCBI 站点的一般规范自行确认。

【质量与限制】

该数据集的一个显著特点是样本量较小，仅包含 3 例组织细胞肉瘤及其对应白血病的数据，这在一定程度上限制了统计推断的效力与结果的普适性。同时，数据集仅涉及 450K array 层面的甲基化信息，未涵盖其他组学层面。关于数据的质控指标、样本纳入排除标准、数据完整性等信息，源站未提供。使用者在使用时应充分考虑样本量有限这一客观情况，避免过度解读分析结果。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，使用时应遵循 NCBI 站点的相关数据使用规范与许可要求。关于数据集的具体引用文献、作者信息、许可条款细节，源站未提供，使用者需在 NCBI 站点上查阅该数据集对应的项目页面以获取准确的引用与许可信息。