PRJNA377303：碱性螺旋-环-螺旋转录因子SHARP1是MLL-AF6急性髓系白血病的致癌驱动因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA377303

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

伴有MLL基因重排的急性髓系白血病（AML）展现出由MLL融合蛋白驱动的独特基因表达谱。在此，我们确定昼夜节律钟转录因子SHARP1为MLL-AF6 AML中的一个新型致癌靶点，该亚型在所有MLL重排AML亚型中预后最差。SHARP1仅表达于MLL-AF6 AML中，且其表达直接受MLL-AF6/DOT1L调控。抑制SHARP1可诱导人MLL-AF6 AML细胞发生显著的细胞凋亡。小鼠中的基因敲除可延缓白血病的发展并减弱白血病起始潜能，同时不影响正常造血。机制上，SHARP1结合于全基因组范围内转录活跃的染色质，并激活对细胞存活至关重要的基因以及MLL-AF6的关键致癌靶点。我们的研究结果证明了SHARP1在MLL-AF6 AML中的独特致癌作用。总体设计：使用ML-2细胞进行ChIP-seq和RNA-seq。使用SHI1细胞进行ChIP-seq。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。