慢性淋巴细胞白血病移植物抗白血病免疫压力下的纵向全外显子组测序
BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的一组生物学数据集合。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用于查找该项目所生成的多种数据类型对应的链接

基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病移植物抗白血病免疫压力下的纵向全外显子组测序
PRJNA1531906 是一个围绕慢性淋巴细胞白血病(Chronic Lymphocytic Leukemia)在移植物抗白血病(Graft-Versus-Leukemia)免疫压力下进行纵向全外显子测序(Longitudinal Whole-Exome Sequencing)的研究计划所建立的 BioProject 记录。该记录隶属于 NCBI 的 BioProject 数据库,本站将其归类于肿瘤 / 白血病方向。BioProject 作为生物学数据的集合性入口,旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处,方便用户查找与访问。该数据集的核心特征在于“纵向”与“全外显子测序”两个维度,并置于移植物抗白血病免疫压力的研究语境之中,为理解该疾病在免疫选择压力下的基因组演化提供了数据组织框架。
【数据集背景】
该数据集对应的研究计划聚焦于慢性淋巴细胞白血病在移植物抗白血病免疫压力下的纵向全外显子测序。移植物抗白血病效应通常与造血干细胞移植后的免疫介导抗肿瘤作用相关,而慢性淋巴细胞白血病作为一种血液系统恶性肿瘤,其基因组在免疫压力下的动态变化是该研究关注的核心。BioProject 作为 NCBI 提供的项目级记录,用于汇集由单一组织或联盟发起的单一研究计划所产生的各类生物学数据。该记录的名称明确体现了研究设计的纵向属性与全外显子测序的技术路线,表明其数据组织围绕同一疾病、同一免疫压力背景下的时间序列样本展开。
【数据内容】
该数据集属于肿瘤 / 白血病分类,其英文名称表明数据内容为慢性淋巴细胞白血病在移植物抗白血病免疫压力下的纵向全外显子测序数据。BioProject 记录本身并不直接存储所有原始数据,而是提供指向该项目所生成的多种数据类型对应链接的统一入口。因此,该数据集的内容涵盖与纵向全外显子测序相关的数据集合,具体的数据文件类型、样本数量、测序深度、变异位点数量等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心。BioProject 记录来源于单一组织或联盟,用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据。该记录提供了查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。关于具体的样本采集地点、采集时间、受试者数量、伦理审批信息以及测序平台等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性淋巴细胞白血病、移植物抗白血病免疫压力、纵向全外显子测序相关的研究场景。研究人员可通过该 BioProject 记录查找该项目所生成的多种数据类型对应的链接,进而获取用于分析白血病基因组在免疫压力下演化过程的数据资源。其纵向设计适合用于探索肿瘤克隆演化、免疫选择压力下的基因组改变等研究方向。具体适用的分析类型与方法,源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问该记录,利用其提供的统一入口查找与该项目相关的多种数据类型链接。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供单一入口,以便定位该项目所生成的不同类型数据。关于具体的数据下载方式、访问权限、所需工具或分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
BioProject 记录作为项目级元数据集合,其本身提供的是数据链接与项目描述,而非直接的质量评估报告。该数据集的质量控制信息、数据完整性、覆盖度、潜在偏差以及使用限制等,源站未提供。用户在使用时应参考该项目所链接的具体数据资源中可能包含的质量说明。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可条款、使用限制以及相关的数据共享政策,源站未提供。用户在使用该 BioProject 记录及其链接的数据时,应遵循 NCBI 及相应数据提供方的通用引用与使用规范。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1531906
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了HLA匹配的异基因干细胞移植(alloSCT)后慢性淋巴细胞白血病(CLL)的基因组演化与免疫逃逸机制。样本来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心治疗的24例CLL患者,其中包括13例持久完全缓解的患者和11例移植后复发的患者。对分选的CD19+CD5+白血病细胞及匹配的种系样本进行全外显子组测序,以表征体细胞突变、克隆结构以及alloSCT和供者淋巴细胞输注(DLI)前后的纵向演化。该研究评估了移植前肿瘤同质性与临床结局之间的关联,并识别了与……相关的基因中的反复改变(更多内容见dbGaP研究页面)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




