PRJNA1098213:ETS1 招募 cBAF 劫持 T 细胞白血病造血干细胞 MYB 增强子(数据集 1)
该数据集来自 NCBI,归类于肿瘤/白血病,主题为表观基因组学。源站描述围绕 T-ALL 中 Notch 信号之外 ETS1 的作用展开:ETS1 与 Notch 共同结合调控元件,其中 MYB +140kb 处的 Notch 结合增强子被命名为 ETS-MYB 增强子(E-Me)
![PRJNA1098213: ETS1 recruits cBAF to hijack the hematopoietic stem cell MYB enhancer in T-cell leukemia [dataset 1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/143430.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1098213:ETS1 招募 cBAF 劫持 T 细胞白血病造血干细胞 MYB 增强子(数据集 1)
该数据集来自 NCBI,归类于肿瘤/白血病,主题为表观基因组学。源站描述围绕 T-ALL 中 Notch 信号之外 ETS1 的作用展开:ETS1 与 Notch 共同结合调控元件,其中 MYB +140kb 处的 Notch 结合增强子被命名为 ETS-MYB 增强子(E-Me)。研究利用基因工程小鼠模型和染色质谱分析,显示 E-Me 选择性促进造血干细胞自我更新、在定向 T 细胞祖细胞中失活,并在 Notch 诱导转化时被重新激活。数据可用于研究 ETS1/cBAF 与 MYB 增强子在白血病发生中的表观调控机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Notch 信号是 T-ALL 中最常见的致癌通路,但临床试验显示泛 Notch 抑制剂会造成剂量限制性毒性。因此,我们将焦点从 Notch 转向 ETS1,后者是在 T-ALL 背景下最常与 Notch 占据的调控元件共同结合的顶级转录因子之一。一个最重要的 ETS1 依赖性元件是 MYB +140kb 处的 Notch 结合增强子,我们将其命名为 ETS-MYB 增强子(E-Me)。利用基因工程小鼠模型和染色质谱分析,我们表明 E-Me 选择性促进造血干细胞的自我更新,在定向 T 细胞祖细胞中失活;并在促进 Notch 诱导的转化时被重新激活。
【主题与分类】
主题标签:Epigenomics。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1098213
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1098213
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Notch信号通路是T-ALL中最常见的致癌途径,但临床试验显示,泛Notch抑制剂会导致剂量限制性毒性。因此,我们将焦点从Notch转向ETS1,ETS1是在T-ALL背景下最常与Notch占据的调控元件共同结合的顶级转录因子之一。一个最重要的ETS1依赖性元件是位于MYB +140kb处的Notch结合增强子,我们将其命名为ETS-MYB增强子(E-Me)。利用基因工程小鼠模型和染色质 profiling,我们发现E-Me选择性促进造血干细胞的自我更新,在定向T细胞祖细胞中失活;并在Notch诱导的转化中被重新激活以促进转化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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