PRJEB90909：HNT-34细胞系中SLAMF6基因敲除效应
该数据集为HNT-34急性髓系白血病（AML）细胞系在CRISPR/Cas9敲除SLAMF6基因（S3/S4）或以靶向萤火虫荧光素酶基因（LUC）的构建体进行模拟敲除后的RNA测序（RNA-seq）数据
基本信息
资源简介
PRJEB90909：HNT-34细胞系中SLAMF6基因敲除效应
该数据集为HNT-34急性髓系白血病（AML）细胞系在CRISPR/Cas9敲除SLAMF6基因（S3/S4）或以靶向萤火虫荧光素酶基因（LUC）的构建体进行模拟敲除后的RNA测序（RNA-seq）数据。文库使用Illumina stranded mRNA prep kit制备，并在Illumina Novaseq 6000系统上测序，数据以原始测序读长（fastq.bz2）形式提供。该数据可用于比较SLAMF6敲除与对照条件下HNT-34细胞的转录组差异，分析SLAMF6在AML细胞中的基因表达调控作用（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含HNT-34急性髓系白血病（AML）细胞系在通过CRISPR/Cas9敲除SLAMF6基因（S3/S4）或以靶向萤火虫荧光素酶基因（LUC）的构建体进行模拟敲除后的RNA测序（RNA-seq）数据。文库使用Illumina stranded mRNA prep kit制备，并在Illumina Novaseq 6000系统（Illumina）上测序。该数据集以原始测序读长（fastq.bz2）形式提供。
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB90909
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB90909
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含HNT-34 AML（急性髓系白血病）细胞系在通过CRISPR/Cas9敲除SLAMF6基因（S3/S4）或使用靶向萤火虫荧光素酶基因（LUC）的构建体进行模拟敲除后的RNA测序（RNA-seq）数据。文库使用Illumina stranded mRNA prep kit制备，并在Illumina Novaseq 6000系统（Illumina）上进行测序。该数据集以原始测序reads（fastq.bz2）形式提供。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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