PRJEB64274:PRDM14在新型B-1细胞恶性肿瘤起始中的功能与分子单细胞分析——Cut and Run实验
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/白血病分类,包含针对PRDM14、H3K4me1和H3K4me3的全基因组Cut and Run实验数据,每种抗体实验设三个重复并含IgG对照

基本信息
资源简介
PRJEB64274:PRDM14在新型B-1细胞恶性肿瘤起始中的功能与分子单细胞分析——Cut and Run实验
该数据集来自NCBI,属于肿瘤/白血病分类,包含针对PRDM14、H3K4me1和H3K4me3的全基因组Cut and Run实验数据,每种抗体实验设三个重复并含IgG对照。数据旨在解析T-ALL小鼠模型中表达Prdm14的细胞类型异质性,特别是白血病前骨髓中异常B-1细胞样群体的关键转录因子基因组结合位点及其B细胞保守和B-1细胞特异性增强子与启动子区域,可用于研究PRDM14在B-1细胞恶性肿瘤起始中的表观遗传调控机制(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):高危白血病亚型的分子机制仍不清楚。PR结构域包含蛋白14(Prdm14)是一种强效癌基因,涉及包括白血病在内的多种癌症的起始。在此,我们在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)小鼠模型中探究表达Prdm14的细胞类型的异质性。我们在白血病前骨髓中鉴定出一个异常的B-1细胞样群体。B-1细胞是在胚胎发育过程中建立的一群自我更新的非常规B细胞。该数据集包含PRDM14、H3K4me1和H3K4me3的全基因组分析,以了解关键转录因子在异常B1群体中的全基因组结合及其B细胞保守和B-1细胞类型特异性增强子和启动子区域。每种抗体的Cut-and-run实验均设三个重复,并额外包含IgG作为实验对照。
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB64274
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB64274
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
白血病高风险亚型的分子机制仍不明确。含PR结构域的蛋白14(Prdm14)是一种强效癌基因,与包括白血病在内的多种癌症的发生有关。在此,我们在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)小鼠模型中探究表达Prdm14的细胞类型的异质性。我们在白血病前期的骨髓中鉴定出一群异常的类B-1细胞群体。B-1细胞是一种在胚胎发育期间建立的具有自我更新能力的非常规B细胞群体。该数据集包含PRDM14、H3K4me1和H3K4me3的全基因组图谱,以了解该关键转录因子在异常B1群体中的全基因组结合情况及其B细胞保守性和B-1细胞类型特异性增强子和启动子区域。每种抗体的Cut-and-run实验均设三个重复,并额外加入IgG作为实验对照。
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