PRJEB64234：功能与分子单细胞分析揭示PRDM14在新型B-1细胞恶性肿瘤起始中的作用——单细胞RNA测序实验

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB64234

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

描述：高风险白血病亚型的分子机制仍不清楚。含PR结构域蛋白14（Prdm14）是一种强效癌基因，与包括白血病在内的多种癌症的发生有关。在此，我们在T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）小鼠模型中探究表达Prdm14的细胞类型的异质性。我们在白血病前期的骨髓中鉴定出一种异常的B-1细胞样群体。B-1细胞是一种在胚胎发育期间建立的自我更新的非常规B细胞群体。该数据集包含四个样本的单细胞转录组图谱。来自R26PR;Mx1-cre小鼠的细胞根据GFP表达（“GFP+”和“GFP-”样本）或根据CD11b- CD19+ CD127+ Sca-1+的促B-1样免疫表型（“白血病前期”样本）进行分选。作为对照，来自R26PR小鼠的免疫表型匹配细胞在根据CD11b- CD19+ CD127+ Sca-1+分选后通过scRNA-seq进行分析（“对照”样本）（补充图2）。因此，我们对总共四个样本进行了scRNA-seq：“GFP+”、“GFP-”、“白血病前期”和“对照”。GFP+和GFP-样本为骨髓样本提供了细胞背景。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。