PRJEB30095：AML 诊断与 HSCT 后复发样本转录组分析
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，为急性髓系白血病（AML）样本的转录组分析数据，涵盖初发或继发 AML 患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）后出现非 HLA 缺失型疾病复发的情况，且这些患者具备移植前与移植后配对的存活白血病样本
基本信息
资源简介
PRJEB30095：AML 诊断与 HSCT 后复发样本转录组分析
PRJEB30095 是一项针对急性髓系白血病（AML）样本的转录组分析数据集，来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集聚焦于初发或继发 AML 患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）后出现非 HLA 缺失型疾病复发的情形，并纳入具备移植前与移植后配对存活白血病样本的患者。通过对这些样本进行转录组层面的刻画，数据集为研究 AML 患者在移植前后白血病细胞转录特征的变化提供了数据基础，属于肿瘤/白血病分类下的转录组学研究资源，主题标签为 Other。
【数据集背景】
急性髓系白血病是一种起源于髓系造血干祖细胞的恶性血液肿瘤。异基因造血干细胞移植是 AML 的重要治疗手段之一，但移植后疾病复发仍是影响患者预后的关键问题。该数据集所针对的正是移植后复发的临床情境，且特别限定于非 HLA 缺失型复发的患者，即复发并非由 HLA 缺失这一免疫逃逸机制所解释的情形。数据集纳入初发或继发 AML 患者，并要求患者同时具备移植前与移植后的存活白血病样本，从而支持对同一患者移植前后白血病细胞转录组状态的配对比较研究。
【数据内容】
该数据集为 AML 样本的转录组分析数据，其核心内容是转录组 profiling（表达谱刻画）。数据覆盖的患者群体为确诊初发或继发 AML、在异基因造血干细胞移植后经历非 HLA 缺失型疾病复发、且拥有移植前与移植后配对的存活白血病样本的个体。因此，数据内容在样本层面体现为同一患者移植前与移植后两个时间点的配对白血病样本的转录组信息。关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式与规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJEB30095: Transcriptome analysis of AML samples at diagnosis and relapse after Hematopoietic Stem Cell Transplantation (HSCT)”。其源站描述表明，该数据是对急性髓系白血病样本的转录组 profiling，纳入的是移植后非 HLA 缺失型复发且具备移植前后配对存活白血病样本的患者。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、测序与建库方法等，源站未提供。
【适用场景】
基于其设计，该数据集适用于围绕 AML 移植后复发机制的转录组研究，尤其是需要在同一患者体内比较移植前与移植后白血病细胞转录特征差异的分析场景；也适用于关注非 HLA 缺失型复发这一特定复发类型的探索性研究。此外，对于初发与继发 AML 相关转录组特征的比较研究，该数据集亦可作为数据来源之一。关于其在药物靶点发现、生物标志物筛选或临床决策支持等方面的具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 ncbi.nlm.nih.gov 获取。使用时应围绕移植前与移植后配对样本的结构组织分析，以体现同一患者两个时间点的对照关系。关于数据下载的具体入口、文件组织方式、预处理与标准化流程、分析工具与参数建议等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的一个明确限定是仅纳入非 HLA 缺失型复发的患者，因此其结论不宜直接外推至 HLA 缺失型复发或其他复发机制的情形。同时，数据集要求患者具备移植前与移植后的存活白血病样本，这一纳入条件可能影响样本的代表性。关于样本量、数据完整性、测序深度、批次效应及质控指标等质量相关信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJEB30095: Transcriptome analysis of AML samples at diagnosis and relapse after Hematopoietic Stem Cell Transplantation (HSCT)”。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献及数据使用许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB30095
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
急性髓系白血病样本的转录组分析。该数据集包括诊断为原发或继发性急性髓系白血病，在异基因造血干细胞移植后经历非HLA丢失疾病复发，并且有移植前后配对的存活白血病样本的患者。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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