慢性淋巴细胞白血病样本RNA测序研究NPM1相关可变剪接
该数据集为NCBI BioProject收录的慢性淋巴细胞白血病（CLL）样本RNA测序数据，旨在研究NPM1相关的可变剪接
基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病样本RNA测序研究NPM1相关可变剪接
该数据集为 NCBI BioProject 收录的慢性淋巴细胞白血病（CLL）样本 RNA 测序数据，英文名称为 PRJEB116050: RNA sequencing of chronic lymphocytic leukemia samples to investigate NPM1-associated alternative splicing。其核心目的在于通过 RNA 测序手段研究 NPM1 相关的可变剪接现象，属于肿瘤 / 白血病领域。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 CLL_NPM1_RNAseq (ID 1491743) - BioProject - NCBI。BioProject 是围绕单一研究计划或由单一机构、联盟发起的生物数据集合，为用户提供统一入口，以链接该项目产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为 Other，侧写线索将其概括为 NCBI BioProject 收录的 CLL 样本 RNA 测序数据，用于研究 NPM1 相关的可变剪接。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病（CLL）是一种血液系统恶性肿瘤，属于白血病范畴。该数据集以 CLL 样本为研究对象，聚焦于 NPM1 相关的可变剪接。可变剪接是真核生物基因表达调控的重要环节，同一前体 mRNA 可通过不同剪接方式产生多种成熟转录本，从而扩展蛋白质组的多样性。NPM1 基因编码核磷蛋白，其异常与多种血液肿瘤相关。该 BioProject 的设立，旨在借助 RNA 测序技术，从转录本层面考察 CLL 样本中与 NPM1 相关的剪接事件。源站描述指出，BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据，并链接该项目生成的不同数据类型，这为理解该数据集的定位提供了框架。
【数据内容】
该数据集属于 RNA 测序数据，样本类型为慢性淋巴细胞白血病样本。其英文名称明确表述为“RNA sequencing of chronic lymphocytic leukemia samples to investigate NPM1-associated alternative splicing”，即对 CLL 样本进行 RNA 测序，以研究 NPM1 相关的可变剪接。数据集的主题标签为 Other。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、读长、测序深度、数据文件格式、转录本定量结果或剪接分析结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 CLL_NPM1_RNAseq (ID 1491743) - BioProject - NCBI。BioProject 作为生物数据的集合记录，来自单一机构或联盟，并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。该数据集被本站归类为肿瘤 / 白血病。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者临床特征、样本处理流程及测序实验的具体操作，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性淋巴细胞白血病及 NPM1 相关可变剪接有关的研究场景。例如，可用于探索 CLL 样本中 NPM1 相关剪接事件的分析，或作为转录本层面研究的参考数据。由于数据集明确以 RNA 测序为手段、以 NPM1 相关可变剪接为目标，其潜在用途包括剪接异构体鉴定、差异剪接分析以及 NPM1 功能相关转录调控研究等方向。但具体适用性取决于数据实际内容与质量，源站未提供详细说明。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 获取，源站标题提供了项目标识 CLL_NPM1_RNAseq (ID 1491743) 以及 BioProject 编号 PRJEB116050。用户可依据 BioProject 记录中的链接访问该项目生成的不同数据类型。关于数据下载方式、文件组织、分析流程、软件工具及参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA 测序数据，其质量与限制取决于原始项目的数据生产与处理过程。源站描述仅说明 BioProject 是生物数据的集合，并提供链接入口，未提供该数据集的具体质量指标、质控结果、批次信息、覆盖度或重复性等信息。因此，关于数据质量与使用限制的详细内容，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 CLL_NPM1_RNAseq (ID 1491743) - BioProject - NCBI。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或版权信息，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB116050
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自24例未接受治疗的慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者外周血样本的bulk RNA测序数据。样本根据NPM1转录本的绝对表达量进行选择，并以首次治疗时间作为临床终点，采用最大选择秩统计量将样本分为NPM1低表达组（n = 12）和NPM1高表达组（n = 12）。仅纳入RNA完整性高（RIN ≥ 9.0）的样本。使用Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus Kit制备总RNA文库，并在Illumina NextSeq 550 Dx平台上采用双端2 × 74 bp测序。该数据集旨在研究CLL中与NPM1表达相关的转录组差异，包括差异基因表达和可变剪接。这些数据支持对慢性淋巴细胞白血病中RNA加工、转录组组织及疾病异质性分子机制的分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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