基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

韩国队列急性髓系白血病群体特异性基因组结构临床意义

该数据集为韩国队列急性髓系白血病（AML）群体特异性基因组结构及其临床意义研究相关的生物项目，英文名称为“PRJEB115196: Clinical implications of population-specific genomic architecture in acute myeloid leukemia in a Korean cohort”，在源站以“Korean AML genomics comparison (ID 1539200) - BioProject - NCBI”为标题呈现，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，本站分类归入肿瘤 / 白血病。其核心关注点在于韩国人群急性髓系白血病的基因组结构特征，以及这些群体特异性结构可能具有的临床意义，可用于围绕该人群开展比较分析。源站对BioProject的通用说明指出，BioProject是围绕单一研究计划、来自单一机构或联合体的一组生物数据集合，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。基于这些信息，该数据集属于以韩国AML队列为对象的基因组学项目记录，主题标签为“Other”。

【数据集背景】

该数据集对应的是一项围绕韩国队列急性髓系白血病的研究计划，重点在于群体特异性基因组结构及其临床意义。源站标题将其描述为“Korean AML genomics comparison”，表明其定位与韩国人群AML基因组比较相关。BioProject作为生物数据集合的通用框架，通常用于汇聚由单一计划或单一机构、联合体产生的多类型数据，因此该记录可视为该项目在NCBI BioProject体系中的入口。本站将其归入肿瘤 / 白血病类别，说明其主题领域与白血病相关。除上述信息外，关于该研究的具体发起机构、研究周期、样本量、临床终点等背景信息，源站未提供。

【数据内容】

从名称与标题看，数据内容围绕韩国队列急性髓系白血病的群体特异性基因组结构及其临床意义展开，可用于比较分析该人群的基因组特征。源站描述仅说明BioProject是相关生物数据的集合，并提供链接以访问该项目生成的不同数据类型，但未具体列出该数据集包含哪些组学层面、哪些文件类型、哪些临床变量或哪些比较分组。因此，关于数据内容的具体构成、数据规模、数据格式、是否包含原始测序数据或处理后数据等，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示其属于NCBI BioProject体系，项目标识为ID 1539200，英文项目名称为PRJEB115196。源站对BioProject的通用描述说明，此类记录来自单一机构或联合体，围绕单一研究计划汇集生物数据。就本数据集而言，其采集地点、采集时间、纳入标准、伦理审批、样本处理流程等具体来源信息，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于围绕韩国人群急性髓系白血病开展群体特异性基因组结构的比较分析，并可探索这些基因组结构特征与临床意义之间的关联。由于本站分类为肿瘤 / 白血病，其潜在使用场景属于白血病基因组学研究范畴。然而，关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否可用于临床决策、是否支持跨人群比较以外的其他用途，源站未提供。

【使用方法】

源站描述指出，BioProject记录为用户提供单一入口，以查找该项目生成的多种数据类型。因此，使用者可通过该BioProject记录访问其关联的数据资源。但关于具体下载方式、数据访问权限、所需分析工具、参考基因组版本、数据处理步骤等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为BioProject记录，其源站描述仅提供项目级集合说明，未给出样本质量、测序深度、数据完整性、批次效应、临床注释准确性等具体质量指标。关于该数据集的限制，例如人群代表性、样本量约束、数据共享限制或使用条件，源站未提供。使用者需注意，当前可确认的信息仅限于项目名称、标题、分类、来源站及BioProject的通用定义，无法据此判断数据质量高低。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB115196

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB115196

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

现有针对急性髓系白血病（AML）的大规模基因组数据集主要来自北美和欧洲人群，导致东亚人群中复发性基因组改变的人群水平分布特征尚未得到充分描述。为解决这一问题，我们在2017年至2021年间前瞻性纳入了来自19家韩国机构的603例新诊断成人AML患者。使用83基因panel对诊断时的骨髓或外周血样本进行了靶向测序。我们采用经年龄和性别调整的逻辑回归，将该韩国AML队列的基因组图谱和临床结局与西方Beat AML队列（n = 515）进行了比较，同时使用逆概率加权进行临床结局评估。本ENA研究包含由603例韩国成人AML患者产生的靶向DNA测序数据。值得注意的是，该数据集新增了260例患者的数据，这些数据未出现在此前注册的研究（PRJEB81954）中，可作为人群特异性AML研究和临床试验设计的可靠基因组参考数据集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别