儿童急性淋巴细胞白血病诊断期骨髓样本长读长RNA测序
该数据集为儿童急性淋巴细胞白血病患者诊断期骨髓样本的长读长RNA测序数据，来源于NCBI BioProject（ID 1488089），属于肿瘤/白血病分类
基本信息
资源简介
儿童急性淋巴细胞白血病诊断期骨髓样本长读长RNA测序
PRJEB115158 是一个聚焦于儿童急性淋巴细胞白血病（pediatric acute lymphoblastic leukemia）诊断期骨髓样本的长读长 RNA 测序数据集。该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库（项目 ID 1488089），在本地分类体系中归属于肿瘤 / 白血病方向。其核心价值在于以长读长 RNA 测序技术刻画儿童急性淋巴细胞白血病患者诊断阶段骨髓样本中的转录本特征，为研究该疾病在初诊状态下的转录异质性提供原始测序数据支撑。数据集标题明确指向“诊断时”（at diagnosis）这一关键时间节点，意味着样本采集发生在治疗干预之前，能够反映疾病自然状态下的转录组面貌。对于关注儿童白血病分子机制、转录本结构变异及异构体多样性分析的研究者而言，该数据集提供了一个以骨髓为样本来源、以长读长测序为技术手段的数据资源入口。
【数据集背景】
该数据集对应的源站标题为“Characterization of Transcriptional Heterogeneity ... (ID 1488089) - BioProject - NCBI”，表明其所属的 BioProject 项目以转录异质性刻画为核心主题。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种类型生物学数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。通过 BioProject 记录，用户可以一站式获取该项目所产生的各类数据链接。本数据集即依托这一框架，将儿童急性淋巴细胞白血病诊断期骨髓样本的长读长 RNA 测序数据纳入统一的项目管理中，便于研究者定位和关联同一研究计划下的其他数据资源。
【数据内容】
该数据集的内容为儿童急性淋巴细胞白血病患者诊断期骨髓样本的长读长 RNA 测序数据。长读长 RNA 测序是一种能够跨越较长转录本片段、有助于解析全长转录本及异构体结构的测序策略。样本类型为骨髓，采集时点明确为诊断期。数据集的主题标签为“Other”。除上述信息外，关于测序平台、样本数量、读长分布、数据量等具体技术参数，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI BioProject 数据库，项目 ID 为 1488089，数据集英文名称为 PRJEB115158。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集自儿童急性淋巴细胞白血病患者，采集时点为诊断期，样本类型为骨髓。关于采集机构、采集时间跨度、伦理审批信息以及具体的研究团队，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于儿童急性淋巴细胞白血病转录组相关的研究场景，尤其是需要利用长读长 RNA 测序数据来探讨诊断期骨髓样本中转录异质性的分析工作。潜在应用包括转录本结构解析、异构体多样性研究以及白血病相关转录特征探索等。由于数据采集于诊断期，也可用于与治疗后样本进行比较研究的基线参考。具体适用场景的详细说明，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库以项目 ID 1488089 进行检索和访问，BioProject 记录提供了指向该项目所产生各类数据的链接入口。关于数据下载格式、分析流程、推荐工具等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 项目记录，其描述强调 BioProject 作为数据汇集入口的功能。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、样本纳入排除标准等质量相关信息，源站未提供。使用者在分析时需自行评估数据适用性。此外，该数据集仅涵盖诊断期骨髓样本，不包含治疗后的纵向样本信息，这一范围限制需在应用时予以考虑。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可条款及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应查阅 NCBI BioProject 项目页面及相关数据文件附带的说明，以获取准确的引用要求和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB115158
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）表现出显著的遗传和转录异质性，这可能影响治疗反应和疾病进展。特别是，编码治疗靶点的基因中的可变剪接和转录本异构体多样性可能导致抗原表达变异和对免疫治疗的耐药性。长读长测序技术为表征全长转录本和识别传统短读长方法难以解析的转录本变异提供了机会。在阿根廷ALLIC-GATLA-2010临床方案框架内，使用Oxford Nanopore Technologies（ONT）长读长测序对儿童B-ALL患者的诊断性骨髓样本进行了分析。生成了全转录组和靶向测序数据，以表征转录本异构体、评估分子分型，并研究治疗靶基因（包括MS4A1（CD20）和CD19）的转录异质性。该数据集为研究转录本多样性及其对儿童B-ALL靶向治疗的潜在意义提供了资源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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