POG_patient_38231 样本数据集

数据以样本形式组织,主题标签为 Genomics,本站归类于肿瘤 / 白血病方向。可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,支持白血病相关的分子分型、变异筛查及肿瘤基因组学研究,为个性化肿瘤分析提供基础数据(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
POG_patient_38231 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

POG_patient_38231 样本数据集

POG_patient_38231 - samples 是一个以样本形式组织、主题标签为 Genomics 的肿瘤相关数据集,来源于 omicsdi.org,本站将其归类于肿瘤 / 白血病方向。该数据集围绕一名 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者展开,包含由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生的基因组与转录组序列数据。作为个性化肿瘤研究的一部分,该数据集可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,支持白血病相关的分子分型、变异筛查及肿瘤基因组学研究,为个性化肿瘤分析提供基础数据。

【数据集背景】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个性化肿瘤分析为目标,通过对患者肿瘤样本进行基因组和转录组测序,获取与肿瘤相关的分子信息。本数据集对应的对象是一名 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者,属于白血病相关肿瘤研究范畴。本站将其归类于肿瘤 / 白血病方向,主题标签为 Genomics,说明其核心内容围绕基因组学展开,并服务于白血病方向的分子特征探索。源站描述明确指出,该数据为来自该 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者的基因组和转录组序列数据,生成背景是 BC Cancer Agency 的 POG 研究。

【数据内容】

该数据集以样本形式组织,包含来自一名 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者的基因组和转录组序列数据。基因组序列数据可用于分析肿瘤基因组中的变异情况,转录组序列数据可用于分析基因表达特征。数据集的主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 白血病,表明其内容聚焦于白血病相关的基因组学信息。数据以样本为单位进行组织,便于围绕该患者样本开展分子层面的探索。源站描述仅说明其为基因组和转录组序列数据,未提供样本数量、测序平台、覆盖深度、变异类型、表达定量指标等更细粒度的内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述指出其由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生。研究对象为一名 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者。数据生成方式为基因组和转录组序列测定,属于该 POG 研究项目的一部分。本站将其归类于肿瘤 / 白血病方向,主题标签为 Genomics。除上述来源与生成背景外,源站未提供关于样本采集时间、采集地点、伦理审批、测序平台、建库方法、数据处理流程等具体信息。

【适用场景】

该数据集可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,支持白血病相关的分子分型、变异筛查及肿瘤基因组学研究,并可为个性化肿瘤分析提供基础数据。具体而言,基因组序列数据可用于变异筛查和肿瘤基因组学分析,转录组序列数据可用于表达特征探索,二者结合有助于从分子层面理解该 T 细胞幼淋巴细胞白血病样本的特征。由于本站分类为肿瘤 / 白血病,该数据集适合用于白血病方向的分子分型研究以及个性化肿瘤分析相关的基础数据支撑。源站未提供关于临床决策支持、疗效预测、预后分析等具体应用场景的说明。

【使用方法】

该数据集以样本形式组织,用户可围绕样本层面获取基因组和转录组序列数据,并据此开展基因组变异分析与转录组表达特征分析。使用时可结合主题标签 Genomics 所指示的基因组学方向,以及本站肿瘤 / 白血病分类所指示的疾病方向,进行分子分型、变异筛查和肿瘤基因组学研究。源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、访问协议、分析流程或软件工具建议,因此相关操作细节需依据源站实际提供的信息确定。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述说明其由 BC Cancer Agency 的 POG 研究产生,研究对象为一名 T 细胞幼淋巴细胞白血病患者。由于数据以样本形式组织,且仅涉及该患者,其覆盖范围限于该个体样本。源站未提供关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、数据完整性或验证情况的信息。此外,源站未提供样本数量、测序平台、数据处理方法、变异注释标准等细节,因此在使用时需注意这些限制。该数据集的主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 白血病,适用方向明确,但具体质量指标与限制条件源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述指出其由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生。源站未提供关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策或版权归属的具体信息。如需引用或使用该数据集,应参考源站 omicsdi.org 及 BC Cancer Agency 的 POG 研究相关说明。除上述来源信息外,源站未提供引用格式、许可类型或使用限制的具体内容。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004907

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名T细胞幼淋巴细胞白血病患者的基因组和转录组序列数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

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