慢性淋巴细胞白血病全基因组分析数据集

该数据集为 dbGaP 收录的慢性淋巴细胞白血病全基因组分析研究,采用肿瘤与配对正常样本比较的设计,属于肿瘤/白血病类别

dbgap
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基因组分类Tumor vs. Matched-Normal
phs000364: Genome-Wide Analysis of Chronic Lymphocytic Leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

慢性淋巴细胞白血病全基因组分析数据集

phs000364 是一项收录于 dbGaP 的慢性淋巴细胞白血病全基因组分析研究,英文全称为 Genome-Wide Analysis of Chronic Lymphocytic Leukemia。该研究采用肿瘤样本与配对正常样本相比较的设计思路,属于肿瘤/白血病类别,主题标签为 Tumor vs. Matched-Normal。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为一项 dbGaP 研究(Tumor vs. Matched-Normal)。整体而言,该数据集围绕慢性淋巴细胞白血病的全基因组层面展开分析,通过配对设计为识别肿瘤相关的基因组变异提供研究材料,适合关注白血病分子机制与肿瘤基因组学的研究者参考使用。

【数据集背景】

慢性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性肿瘤之一,其发生发展涉及基因组层面的多种改变。phs000364 以全基因组分析为研究切入点,聚焦慢性淋巴细胞白血病这一具体病种,归属于肿瘤/白血病分类之下。该研究在 dbGaP 平台登记收录,dbGaP 是 NCBI 维护的基因型与表型数据存储库,通常用于存放受控访问的人类遗传学研究数据。研究采用肿瘤与配对正常样本比较的策略,这一设计有助于在个体内部对照的框架下考察肿瘤细胞相对于自身正常细胞的基因组差异。源站对该研究的描述为 dbGaP study (Tumor vs. Matched-Normal),点明了其核心设计特征。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Tumor vs. Matched-Normal,表明其数据组织围绕肿瘤样本与配对正常样本的对照关系展开。研究名称为全基因组分析,说明数据涉及全基因组范围的分析内容。关于具体的样本数量、测序平台、变异类型、文件格式与数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,为 dbGaP 收录的研究项目,编号 phs000364。源站将其描述为一项 dbGaP 研究,采用肿瘤与配对正常样本比较的设计。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准以及伦理审批等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其病种与设计特征,该数据集可用于慢性淋巴细胞白血病相关的肿瘤基因组学研究,例如在肿瘤与配对正常样本对照框架下考察基因组层面的差异。其主题标签所体现的配对比较设计,也适合用于需要个体内对照的研究思路。关于该数据集在其他具体应用方向上的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台发布,属于 dbGaP 研究项目。关于具体的访问权限层级、申请流程、数据下载方式与分析工具要求,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的研究项目,源站描述为肿瘤与配对正常样本比较的设计。关于数据质量评估指标、样本完整性、覆盖度以及使用中的具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,编号 phs000364。关于具体的引用格式、许可条款与数据使用协议,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000364

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Tumor vs. Matched-Normal).

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