RAS通路突变诱导急性髓系白血病中MEK抑制与线粒体氧化代谢合成致死

该数据集来自omicsdi.org,为初诊原发性急性髓系白血病(AML)样本的bulk RNAseq转录组数据,主题标签为Transcriptomics,属于肿瘤/白血病分类

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时间序列预测Transcriptomics
Mutations in RAS pathway induce synthetic lethality of MEK inhibition with mitochondrial oxidative metabolism in acute myeloid leukemia

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

RAS通路突变诱导急性髓系白血病中MEK抑制与线粒体氧化代谢合成致死

该数据集英文名为 Mutations in RAS pathway induce synthetic lethality of MEK inhibition with mitochondrial oxidative metabolism in acute myeloid leukemia,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,本站归类为肿瘤 / 白血病。根据源站描述,该数据集为初诊原发性急性髓系白血病(AML)样本的 bulk RNAseq 转录组数据。整体来看,该数据集围绕急性髓系白血病这一血液系统恶性肿瘤,提供初诊阶段原发性样本的批量转录组测序信息,可用于从转录层面观察白血病样本的基因表达特征,并与 RAS 通路突变、MEK 抑制及线粒体氧化代谢相关的合成致死研究背景相联系。以下依据可获得的信息对该数据集作进一步说明。

【数据集背景】

该数据集名称指向 RAS 通路突变与 MEK 抑制、线粒体氧化代谢之间合成致死关系的研究背景,研究对象为急性髓系白血病。急性髓系白血病是起源于髓系造血细胞的恶性克隆性疾病,其分子特征与治疗响应是相关研究关注的重点。该数据集以初诊原发性 AML 样本为材料,通过 bulk RNAseq 获取转录组信息,为在转录水平上考察白血病样本的分子特征提供了数据基础。本站将其归入肿瘤 / 白血病分类,主题标签为 Transcriptomics,表明其核心数据类型为转录组学数据。

【数据内容】

源站描述该数据集为初诊原发性 AML 样本的 bulk RNAseq 数据。Bulk RNAseq 是对样本中混合细胞群体的 RNA 进行高通量测序,可获得基因表达层面的整体转录组信息。该数据集的主题标签为 Transcriptomics,说明其内容属于转录组学范畴。关于样本数量、测序平台、读长、表达定量结果文件的具体形式、是否包含临床注释等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述明确其材料为初诊原发性 AML 样本,采集时点为诊断时。数据通过 bulk RNAseq 方式产生。关于样本采集机构、测序服务提供方、原始数据存放位置及具体采集流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其转录组学属性与初诊原发性 AML 样本背景,该数据集可用于白血病转录表达特征的一般性观察,也可作为围绕 RAS 通路突变、MEK 抑制与线粒体氧化代谢合成致死研究方向的相关分析素材。由于源站描述仅说明为 bulk RNAseq,未提供更细的分析设计信息,具体适用场景应以源站说明为准;其他延伸用途源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 bulk RNAseq 转录组数据,常规使用方式包括对表达数据进行质控、比对与定量,并在此基础上开展表达差异、通路富集等分析。关于该数据集是否提供预处理后的表达矩阵、使用何种参考基因组与注释版本、推荐的分析流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为初诊原发性 AML 样本的 bulk RNAseq 数据,bulk 测序反映的是样本内混合细胞群体的平均表达信号,难以直接解析单细胞层面的异质性。关于样本量、测序深度、数据质控指标、批次信息及数据完整性等质量相关信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、发表文献、许可协议及使用限制等信息,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10048

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Bulk RNAseq of primary AML samples at diagnosis

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