RAS通路突变诱导急性髓系白血病中MEK抑制与线粒体氧化代谢合成致死
该数据集来自omicsdi.org,为初诊原发性急性髓系白血病(AML)样本的bulk RNAseq转录组数据,主题标签为Transcriptomics,属于肿瘤/白血病分类

基本信息
资源简介
RAS通路突变诱导急性髓系白血病中MEK抑制与线粒体氧化代谢合成致死
该数据集英文名为 Mutations in RAS pathway induce synthetic lethality of MEK inhibition with mitochondrial oxidative metabolism in acute myeloid leukemia,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,本站归类为肿瘤 / 白血病。根据源站描述,该数据集为初诊原发性急性髓系白血病(AML)样本的 bulk RNAseq 转录组数据。整体来看,该数据集围绕急性髓系白血病这一血液系统恶性肿瘤,提供初诊阶段原发性样本的批量转录组测序信息,可用于从转录层面观察白血病样本的基因表达特征,并与 RAS 通路突变、MEK 抑制及线粒体氧化代谢相关的合成致死研究背景相联系。以下依据可获得的信息对该数据集作进一步说明。
【数据集背景】
该数据集名称指向 RAS 通路突变与 MEK 抑制、线粒体氧化代谢之间合成致死关系的研究背景,研究对象为急性髓系白血病。急性髓系白血病是起源于髓系造血细胞的恶性克隆性疾病,其分子特征与治疗响应是相关研究关注的重点。该数据集以初诊原发性 AML 样本为材料,通过 bulk RNAseq 获取转录组信息,为在转录水平上考察白血病样本的分子特征提供了数据基础。本站将其归入肿瘤 / 白血病分类,主题标签为 Transcriptomics,表明其核心数据类型为转录组学数据。
【数据内容】
源站描述该数据集为初诊原发性 AML 样本的 bulk RNAseq 数据。Bulk RNAseq 是对样本中混合细胞群体的 RNA 进行高通量测序,可获得基因表达层面的整体转录组信息。该数据集的主题标签为 Transcriptomics,说明其内容属于转录组学范畴。关于样本数量、测序平台、读长、表达定量结果文件的具体形式、是否包含临床注释等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述明确其材料为初诊原发性 AML 样本,采集时点为诊断时。数据通过 bulk RNAseq 方式产生。关于样本采集机构、测序服务提供方、原始数据存放位置及具体采集流程等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其转录组学属性与初诊原发性 AML 样本背景,该数据集可用于白血病转录表达特征的一般性观察,也可作为围绕 RAS 通路突变、MEK 抑制与线粒体氧化代谢合成致死研究方向的相关分析素材。由于源站描述仅说明为 bulk RNAseq,未提供更细的分析设计信息,具体适用场景应以源站说明为准;其他延伸用途源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 bulk RNAseq 转录组数据,常规使用方式包括对表达数据进行质控、比对与定量,并在此基础上开展表达差异、通路富集等分析。关于该数据集是否提供预处理后的表达矩阵、使用何种参考基因组与注释版本、推荐的分析流程等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为初诊原发性 AML 样本的 bulk RNAseq 数据,bulk 测序反映的是样本内混合细胞群体的平均表达信号,难以直接解析单细胞层面的异质性。关于样本量、测序深度、数据质控指标、批次信息及数据完整性等质量相关信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、发表文献、许可协议及使用限制等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10048
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Bulk RNAseq of primary AML samples at diagnosis
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