miR-3151与宿主基因BAALC相互作用并独立影响细胞遗传学正常急性髓系白血病患者结局的表达微阵列数据
该数据集为表达微阵列数据,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/白血病。数据涉及细胞遗传学正常的初诊急性髓系白血病(CN-AML)患者队列中miR-3151与宿主基因BAALC的表达测量,用于评估miR-3151表达对患者结局的影响及其与BAALC的相互作用

基本信息
资源简介
miR-3151与宿主基因BAALC相互作用并独立影响细胞遗传学正常急性髓系白血病患者结局的表达微阵列数据
该数据集为表达微阵列数据,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/白血病。数据涉及细胞遗传学正常的初诊急性髓系白血病(CN-AML)患者队列中miR-3151与宿主基因BAALC的表达测量,用于评估miR-3151表达对患者结局的影响及其与BAALC的相互作用。数据主题为转录组学,可用于研究内含子microRNA与宿主基因的功能协同关系及预后相关分析(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):近期,对黑色素瘤和儿童急性淋巴细胞白血病样本的深度测序鉴定出一个新的microRNA——miR-3151——嵌入在BAALC基因的内含子1中。MiR基因遍布整个基因组,但约三分之一的哺乳动物miR位于宿主基因的内含子内。其中一些内含子miR已被发现与其宿主基因发挥功能协同作用。这些发现使我们假设miR-3151可能在BAALC水平升高的患者中过表达,从而可能促成其宿主基因的不良预后影响,无论是与BAALC协同作用,还是甚至可能是主要导致BAALC过表达AML患者中观察到的不良结局的因素。因此,我们在一组分子特征明确的初诊CN-AML患者队列中测量了miR-3151和BAALC的表达,以评估miR-3151表达的影响
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-1075
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-1075
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
近期,对黑色素瘤和儿童急性淋巴细胞白血病样本的深度测序发现了一种新的微小RNA——miR-3151,它嵌入在BAALC基因的内含子1中。miR基因遍布整个基因组,但约三分之一的哺乳动物miR位于宿主基因的内含子内。已发现其中一些内含子miR与其宿主基因在功能上协同作用。这些发现使我们推测,miR-3151可能在BAALC水平升高的患者中过表达,从而可能促成其宿主基因的不良预后影响,无论是与BAALC协同作用,还是甚至可能是导致BAALC过表达AML患者观察到的不良结局的主要因素。因此,我们在一组分子特征明确的初发CN-AML患者中测量了miR-3151和BAALC的表达,以评估miR-3151单独表达及其与宿主BAALC联合对结局的影响。使用微阵列技术,我们得出了与老年细胞遗传学正常急性髓系白血病患者中miR-3151表达相关的microRNA表达谱。
相应的microRNA表达数据可在登录号E-MTAB-1074下找到。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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