巴西儿童急性淋巴细胞白血病MicroRNA测序数据

该数据集为巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者的骨髓样本MicroRNA测序数据,涵盖B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)与T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)两类

biostudies
浏览 8
基因组分类Homo sapiens
MicroRNA-sequencing of Brazilian pediatric acute lymphoblastic leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

巴西儿童急性淋巴细胞白血病MicroRNA测序数据

该数据集为巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者的骨髓样本MicroRNA测序数据,涵盖B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)与T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)两类。数据以高通量测序方式对microRNA进行表达谱分析,研究对象为人(Homo sapiens)骨髓样本,来源站为ebi.ac.uk,在分类上归属于肿瘤/白血病方向。该数据集可用于观察儿童急性淋巴细胞白血病不同亚型中microRNA的表达特征,为相关研究提供测序层面的数据基础。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是儿童期常见的血液系统恶性肿瘤,按免疫表型可分为B细胞来源与T细胞来源等类型。microRNA是一类在基因表达调控中发挥重要作用的非编码小RNA,其表达谱变化与肿瘤的发生发展、分型及预后等研究密切相关。该数据集以巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者为研究对象,针对骨髓样本开展microRNA测序,旨在从microRNA层面刻画B-ALL与T-ALL两类患者的表达特征,为白血病相关的基础与转化研究提供数据支撑。

【数据内容】

该数据集的核心内容为骨髓样本的microRNA测序数据,样本来自巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者,覆盖B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)与T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)两类。主题标签显示其属于microRNA profiling by high throughput sequencing,物种为Homo sapiens。数据所反映的是microRNA表达谱层面的信息,可用于比较不同免疫表型白血病样本之间microRNA表达的差异。关于样本的具体数量、测序平台型号、读长、数据文件格式与数据量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于ebi.ac.uk。样本类型为骨髓样本,采集对象为巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者,并按B-ALL与T-ALL进行区分。关于样本采集的具体临床机构、采集时间、伦理审批信息以及测序实验的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于白血病相关的microRNA表达谱研究,例如B-ALL与T-ALL之间microRNA表达差异的比较分析、microRNA作为潜在生物标志物的探索性研究,以及与其他急性淋巴细胞白血病转录组或测序数据的整合分析。也可用于方法学研究中作为高通量microRNA测序数据的实例。具体应用方向需结合研究者自身的研究设计与数据实际情况确定。

【使用方法】

使用该数据集时,可先依据样本的免疫表型分组(B-ALL与T-ALL)组织数据,再进行microRNA表达定量与差异表达分析等常规测序数据处理流程。由于源站未提供测序平台、文件格式与数据处理细节,实际分析前需自行查阅源站记录以确认数据组织方式与元数据信息。使用时应注意样本分组信息与表达谱数据的对应关系,确保分析结果的可解释性。

【质量与限制】

该数据集聚焦于巴西儿童急性淋巴细胞白血病患者的骨髓样本,样本来源在地域与人群上具有特定性,结论外推至其他人群时需谨慎。关于样本量、测序深度、数据质控指标、缺失值情况以及是否存在批次效应等信息,源站未提供。使用者在分析中应自行开展质量控制与必要的校正处理。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可条款,源站未提供。使用前应查阅源站对应记录以获取准确的引用要求与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-11621

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-MTAB-11621 巴西儿童急性淋巴细胞白血病的MicroRNA测序 通过高通量测序进行microRNA分析 EFO EFO_0002896 智人 对巴西B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)儿童患者骨髓样本进行的MicroRNA测序

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