儿童AML microRNA表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-52541

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MicroRNAs（miRNAs）在造血调控和白血病发生中发挥关键作用。以治疗为目的调控miRNA表达引起了极大兴趣。为了鉴定能够通过诱导分化特异性抑制伴有t(8;21)、inv(16)或MLL重排的AML白血病生长的miRNA，我们在90例经细胞遗传学特征分析的初诊儿童AML病例队列中进行了miRNA表达谱分析。四种在MLL重排、t(8;21)或inv(16) AML中特异性下调的miRNA，在代表相应细胞遗传学组的细胞系中表现出肿瘤抑制特性。其中，强制表达miR-9可在体外和体内降低t(8;21) AML细胞系的白血病生长并诱导单核细胞分化。miR-9的肿瘤抑制功能特异性地局限于伴有t(8;21)的AML细胞系和原代白血病原始细胞。另一方面，这些功能在MLL重排患者的AML原始细胞中不明显。我们证明，miR-9通过与let-7协同作用抑制致癌性LIN28B/HMGA2轴来发挥其效应。

因此，miR-9是一种抑癌miRNA，其作用严格依赖于细胞环境。为了鉴定能够通过诱导分化特异性抑制伴有t(8;21)（n=21）、inv(16)（n=17）或MLL重排（n=35）的AML白血病生长的miRNA，我们在一个包含90例经细胞遗传学特征分析的初诊儿童AML病例队列中进行了miRNA表达谱分析，该队列还包括12例t(15;17)和5例t(7;12)样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。