欧洲、日本和美国JMML患者450k甲基化芯片meta数据集

该数据集为基于450k芯片的DNA甲基化分析数据,样本来自欧洲、日本和美国的JMML患者。JMML属于白血病相关疾病,数据主题标签为Genomics

omicsdi
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基因组分类Genomics
Methylation450k_JMML_meta_Schoenung

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

欧洲、日本和美国JMML患者450k甲基化芯片meta数据集

Methylation450k_JMML_meta_Schoenung 是一个面向肿瘤与白血病研究领域的DNA甲基化数据集,其核心内容是对幼年型粒单核细胞白血病(JMML)患者样本进行甲基化分析所获得的数据。该数据集采用450k芯片技术,样本来源覆盖欧洲、日本和美国三个地区,主题标签为Genomics。作为一项跨区域的甲基化研究资源,它为探索JMML这一白血病相关疾病的表观遗传特征提供了数据基础。整体而言,该数据集聚焦于DNA甲基化层面的基因组学信息,适合用于白血病相关机制研究、表观遗传标志物探索以及跨人群比较分析等方向。

【数据集背景】

该数据集的全称为Methylation450k_JMML_meta_Schoenung,属于肿瘤/白血病分类下的基因组学数据资源。其来源站为omicsdi.org。根据源站描述,该数据集的核心研究内容是针对来自欧洲、日本和美国的JMML患者进行DNA甲基化分析,所采用的技术平台为450k芯片。JMML属于白血病相关疾病,因此该数据集在疾病分类上归属于白血病研究范畴,在数据主题上归属于Genomics。该数据集的建立与跨区域样本采集和分析相关,旨在从DNA甲基化层面刻画JMML患者的表观遗传特征。

【数据内容】

该数据集的内容为DNA甲基化分析数据,基于450k芯片产生。样本来自欧洲、日本和美国的JMML患者。数据主题标签为Genomics。源站描述明确指出,该数据集是使用450k芯片对来自欧洲、日本和美国的JMML患者进行的DNA甲基化分析。关于具体的样本数量、甲基化位点数量、数据文件格式、数据大小、临床变量信息等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。根据源站描述,样本采集自欧洲、日本和美国的JMML患者,分析方式为使用450k芯片进行DNA甲基化检测。关于具体的采集机构、采集时间、伦理审批信息、样本纳入与排除标准、各区域样本的具体分配情况等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤与白血病相关研究,尤其是针对JMML的DNA甲基化分析。其主题标签为Genomics,因此可应用于基因组学与表观遗传学交叉领域的研究场景。由于样本来自欧洲、日本和美国三个地区,该数据集也可能适用于跨区域或跨人群的甲基化比较研究。具体适用场景包括但不限于:JMML甲基化谱特征分析、甲基化标志物探索、不同地区样本的甲基化差异比较等。关于该数据集是否已被用于特定研究项目或是否具有明确的推荐应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集基于450k芯片产生DNA甲基化数据,属于基因组学数据资源。关于具体的数据下载方式、数据格式、预处理流程、分析工具推荐、质量控制步骤、归一化方法等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于450k芯片技术,样本来自欧洲、日本和美国的JMML患者。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应处理、样本量大小、数据覆盖度、技术重复情况、验证实验信息等,源站未提供。使用者在应用该数据集时,应结合自身研究目的对数据适用性进行判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、知识产权归属等信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001999

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DNA methylation analysis of JMML patients from Europe, Japan and USA using 450k arrays

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