儿童及青年T细胞急性淋巴细胞白血病诱导失败数据集

该数据集来自 omicsdi.org,聚焦儿童及青年 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)诱导失败病例,包含 48 例患者的全基因组测序(WGS)与 RNA 测序(RNAseq)数据,其中 WGS 覆盖 33 对肿瘤/正常配对样本及 15 例仅肿瘤样本,RNAseq 覆盖 37 例

omicsdi
浏览 10
基因组分类Genomics
Induction Failure in Childhood and Young Adult T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

儿童及青年T细胞急性淋巴细胞白血病诱导失败数据集

该数据集名为 Induction Failure in Childhood and Young Adult T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia,来源于 omicsdi.org,聚焦儿童及青年 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)诱导失败病例的基因组学研究。研究对 48 例诱导失败患者开展了全基因组测序(WGS)与 RNA 测序(RNAseq),旨在识别导致治疗抵抗的基因组驱动因素。其中 WGS 覆盖 33 对肿瘤/正常配对样本及 15 例仅肿瘤样本,RNAseq 覆盖 37 例病例。数据集主题标签为 Genomics,本站分类归入肿瘤 / 白血病。整体而言,该数据集为研究 T-ALL 诱导失败的分子机制提供了测序层面的资源。

【数据集背景】

该数据集围绕儿童及青年 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的诱导失败展开。诱导失败是 T-ALL 治疗中需要重点关注的临床问题,而该研究的目的正是通过全基因组测序与 RNA 测序,识别与治疗抵抗相关的基因组驱动因素。数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 白血病。

【数据内容】

数据集包含两类测序数据:全基因组测序(WGS)与 RNA 测序(RNAseq)。WGS 覆盖 33 对肿瘤/正常配对样本以及 15 例仅肿瘤样本;RNAseq 覆盖 37 例病例。研究对象为 48 例儿童及青年 T-ALL 诱导失败患者。除上述样本数量与测序类型外,源站未提供更细的变异类型、表达矩阵或临床字段说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 omicsdi.org。研究对象为 48 例儿童及青年 T-ALL 诱导失败患者,样本包括肿瘤/正常配对样本与仅肿瘤样本。源站未提供具体的样本采集地点、采集时间、机构信息及测序平台细节。

【适用场景】

该数据集适用于 T-ALL 诱导失败相关的基因组学研究,可用于探索治疗抵抗的基因组驱动因素,也可作为 WGS 与 RNAseq 联合分析的数据资源。由于包含肿瘤/正常配对样本与仅肿瘤样本,可用于配对与非配对设计下的分析。源站未提供具体的分析应用案例或验证结论。

【使用方法】

源站未提供具体的数据访问方式、文件格式、下载流程或分析工具说明。使用者需依据 omicsdi.org 上的数据集条目获取进一步信息。

【质量与限制】

源站未提供质控指标、测序深度、覆盖度或数据完整性说明。需注意该数据集样本量为 48 例,WGS 中 15 例为仅肿瘤样本,缺少配对正常样本;RNAseq 覆盖 37 例,与 WGS 样本数不完全一致。除此之外,源站未提供其他质量与限制信息。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001006411

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对48名T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)诱导治疗失败的儿童及青年患者队列进行了全基因组测序(WGS)和RNA测序(RNAseq),以识别治疗耐药的基因组驱动因素。研究包括33对肿瘤/正常样本和15例仅肿瘤样本的WGS数据。此外,还有37例病例的RNAseq数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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