利用协同交叉方法鉴定人idelalisib毒性候选风险因子基因

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A7acddb54e79116b74e991c0c4548451a26141136d0665e1a45bdaf1ba7aff59b

标准获取流程：

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数据说明

Idelalisib是一种对δ亚型具有高度选择性的磷脂酰肌醇3-激酶抑制剂，在治疗慢性淋巴细胞白血病和滤泡性淋巴瘤方面显示出良好疗效。然而，在临床试验中，idelalisib与罕见但可能严重的肝脏和肺部毒性相关。在本研究中，我们利用Collaborative Cross（CC）小鼠群体来识别与药物反应相关的遗传因素，这些因素可能为人类使用idelalisib的风险管理策略提供参考。来自50个CC品系的八（8）只雄性小鼠（4对匹配）通过口服灌胃每天给药一次，连续14天，给予溶媒或idelalisib，剂量选择为实现临床相关峰血浆浓度（150 mg/kg/天）。该药物在所有CC品系中耐受良好，未观察到明显肝损伤。在研究第1天、第7天和第14天约Tmax采集的血浆样本中，不同CC品系间药物浓度存在差异。

血浆总胆汁酸和microRNA-122也出现了虽小但具有统计学显著性的治疗诱导性改变，这些改变可能提示早期肝细胞应激，而后者是人类免疫介导性肝毒性所必需的。Idelalisib治疗还进一步诱导终末支气管肺泡灌洗液总细胞计数显著升高，这可能类似于临床观察到的肺炎。遗传定位识别出与 interim 血浆idelalisib浓度及其他三个治疗相关终点相关的位点。在CC小鼠中识别出的13个优先候选数量性状基因，现在可能为探究人类中与idelalisib相关的不良药物反应风险因素提供指导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。