血液病理学家注释的急性髓系白血病诊断样本质谱流式数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aef9e638c3c54f4e1be8092c79ad9071d9c82afb3c40d942ae1197252d10229d1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自急性髓系白血病（AML）患者的血液病理学家注释的单细胞数据，来源于FlowRepository（ID：FR-FCMZ2E7）。数据集包括经归一化处理、单细胞门控的事件，注释由Tsai等人的作者团队提供，排除了1例诊断为骨髓增生异常综合征（MDS）的患者，因其诊断存在模糊性。为与原始细胞计数标准和病理实验室流程保持一致，分析中仅纳入CD45+造血谱系细胞。数据预处理遵循标准质谱流式细胞术方案，包括以5为辅因子的反双曲正弦变换、将标志物缩放至其第99.9百分位数，并排除标志物值超过该阈值的细胞，以去除伪影和离群值。

该数据集使用R包tidytof进行处理，为通过单细胞分析研究AML的研究人员提供了高质量资源。，# 血液病理学家注释的急性髓系白血病诊断标本质谱流式数据集 https://doi.org/10.5061/dryad.jq2bvq8kj ## 数据和文件结构描述 该数据集最初用于研究AML中的单细胞形态学分析，现已由一位血液病理学家进行注释，提供区分癌性原始细胞与健康骨髓细胞的单细胞标签。这些专家注释，结合高维分子和形态学数据，使该数据集特别适合用于开发和验证用于疾病相关细胞识别的机器学习方法。细胞水平注释的加入使得诸如训练分类器以识别白血病细胞和选择具有生物学意义的特征等应用成为可能。该资源支持单细胞数据分析的进步，并为研究急性髓系白血病及相关疾病提供了有价值的基准，本研究使用的所有人类受试者数据

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。