48例儿童AML样本的编码与非编码基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE98697

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长链非编码RNA（lncRNA）和miRNA已成为基因表达和细胞命运决定的关键调控因子。本文对纯化的人造血干细胞（HSC）及其分化后代（包括粒细胞、单核细胞、T细胞、NK细胞、B细胞、巨核细胞和红系前体细胞）的ncRNA转录组进行了整合分析，并将其与48例儿童AML样本的ncRNA表达谱进行关联，以确立AML中核心的lncRNA干细胞特征。对46例儿童AML样本（包括唐氏综合征AMKL、核心结合因子AML（inv[16]或t[8;21]）及MLL重排白血病）进行线性（PCA）和非线性（t-SNE）降维分析，将大多数样本与髓系祖细胞一同映射至HSC与分化细胞之间的空间。一部分AML样本（包括大多数DS-AMKL和MLL-AML）与健康HSC紧密映射。在将急性髓系白血病（AML）样本纳入该图谱后，我们进一步揭示了AML原始细胞与健康造血干细胞之间共享的具有预后相关性的ncRNA干细胞特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。