肺移植慢性肺移植物功能障碍患者全血基因表达数据

该数据集来自 NCBI,收录肺移植后慢性肺移植物功能障碍(CLAD)患者的全血基因表达谱。研究对 80 例患者(40 例稳定 STA、40 例 BOS)进行微阵列实验,鉴定出 47 个在 STA 与 BOS 受者间差异表达的基因;另用独立患者组(13 例 STA、11 例 BOS)通过 qPCR 进

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL136079606
GSE94557: Whole blood gene expression from lung transplanted patients with chronic lung allograft dysfunction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

肺移植慢性肺移植物功能障碍患者全血基因表达数据

Whole blood gene expression from lung transplanted patients with chronic lung allograft dysfunction

该数据集来自 NCBI,收录肺移植后慢性肺移植物功能障碍(CLAD)患者的全血基因表达谱。研究对 80 例患者(40 例稳定 STA、40 例 BOS)进行微阵列实验,鉴定出 47 个在 STA 与 BOS 受者间差异表达的基因;另用独立患者组(13 例 STA、11 例 BOS)通过 qPCR 进行外部验证,涉及 POU2AF1、TCL1A 和 BLK 等基因。数据可用于筛选 BOS 早期生物标志物、构建分类模型,以支持 CLAD 的早期识别与干预(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 06 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性肺移植物功能障碍(CLAD)限制了肺移植后的长期生存。CLAD 在肺功能下降时才被晚期诊断,此时任何免疫干预均无效。因此,识别 CLAD 的早期先兆对于在移植物发生不可逆损伤之前阻止疾病进展至关重要。我们使用全血细胞的大规模基因表达谱分析来识别闭塞性细支气管炎综合征(BOS)的早期生物标志物,BOS 是 CLAD 的主要形式。对 80 例患者(40 例稳定(STA)和 40 例 BOS)进行的微阵列实验鉴定出 47 个在 STA 与 BOS 受者之间差异表达的基因。随后使用独立患者组(13 例 STA,11 例 BOS)通过 qPCR 进行外部验证。POU Class 2 Associating Factor 1 (POU2AF1)、T-cell leukemia/lymphoma protein 1A (TCL1A) 和 B-cell lymphocyte kinase (BLK) 基因 wer

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL13607、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE94557

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 27 201,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性肺移植物功能障碍(CLAD)限制了肺移植后的长期生存。CLAD在肺功能下降时才被晚期诊断,此时任何免疫干预均已无效。因此,识别CLAD的早期前兆对于在移植物发生不可逆损伤之前阻止疾病进展至关重要。我们利用全血细胞的大规模基因表达谱分析来识别闭塞性细支气管炎综合征(BOS)——CLAD的主要形式——的早期生物标志物。对80例患者(40例稳定(STA)和40例BOS)进行的微阵列实验识别出47个在STA与BOS受者之间差异表达的基因。随后使用一组独立患者(13例STA,11例BOS)通过qPCR进行外部验证。POU Class 2 Associating Factor 1(POU2AF1)、T-cell leukemia/lymphoma protein 1A(TCL1A)和B-cell lymphocyte kinase(BLK)基因被识别并验证为BOS的诊断前6个月以上的预测标志物,其AUC分别为0.83、0.77和0.78。

这些基因能够根据CLAD风险进行分层(对数秩检验p<0.01),并可能为临床医生提供新工具,以改善对可能发展为BOS的患者的随访和调整治疗。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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