适用于FFPE活检的套细胞淋巴瘤增殖特征新型分子检测

源站描述指出套细胞淋巴瘤(MCL)是一种侵袭性B细胞肿瘤,治疗后结局异质;2003年LLMPP基于新鲜冷冻材料基因表达定义了“增殖特征”生物标志物,本研究训练并验证了一种新检测方法,可在常规福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检RNA中测量增殖特征

geo
浏览 2
基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE93291: A new molecular assay for the proliferation signature in mantle cell lymphoma applicable to formalin-fixed paraffin-embedded biopsies

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

适用于FFPE活检的套细胞淋巴瘤增殖特征新型分子检测

A new molecular assay for the proliferation signature in mantle cell lymphoma applicable to formalin-fixed paraffin-embedded biopsies

该数据集来自NCBI GEO(GSE93291),包含1个文件(GSE93291_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/白血病。源站描述指出套细胞淋巴瘤(MCL)是一种侵袭性B细胞肿瘤,治疗后结局异质;2003年LLMPP基于新鲜冷冻材料基因表达定义了“增殖特征”生物标志物,本研究训练并验证了一种新检测方法,可在常规福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检RNA中测量增殖特征。数据可用于基因表达谱分析与分类研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 07 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):套细胞淋巴瘤(MCL)是一种侵袭性B细胞肿瘤,治疗后结局异质。2003年,淋巴瘤/白血病分子谱分析项目利用新鲜冷冻材料中的基因表达描述了一个强大的生物标志物——“增殖特征”。在此,我们描述了一种新检测方法的训练和验证,该方法可在常规可获得的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检样本提取的RNA中测量增殖特征。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93291

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93291

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

套细胞淋巴瘤(MCL)是一种侵袭性B细胞肿瘤,治疗后结局异质性强。2003年,淋巴瘤/白血病分子谱分析项目利用新鲜冷冻材料中的基因表达,描述了一种强有力的生物标志物——“增殖特征”。在此,我们描述了一种新检测方法的训练与验证,该方法可在常规可得的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)活检组织提取的RNA中测定增殖特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。