Lamin B1调控B细胞恶性肿瘤体细胞突变与进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89869

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

体细胞超突变（SHM）是适应性免疫中的一个关键过程，发生在生发中心，使B细胞能够改变其初级DNA序列并使抗原受体多样化。在此，我们报告，Lamin B1（一种参与表观遗传染色质调控的核膜组分）的基因组结合在B细胞活化及淋巴生发中心形成过程中减少。ChIP-Seq分析显示，当B细胞中诱导SHM时，κ链和重链可变免疫球蛋白结构域从Lamin B1的抑制环境中释放。RNAi介导的Lamin B1减少导致自发性SHM以及κ轻链异常表面表达。最后，Lamin B1表达水平与慢性淋巴细胞白血病的5年生存率呈正比，并与滤泡性淋巴瘤的转化密切相关。总之，我们在此报告，Lamin B1是正常B细胞中SHM的负性表观遗传调控因子，也是一种“突变守门人”，抑制驱动淋系恶性肿瘤的异常突变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。