LIF处理的脊索瘤细胞系U-CH1和MUG-Chor1表达数据
该数据集为GSE86036，来源于NCBI，包含经白血病抑制因子（LIF）处理的脊索瘤细胞系U-CH1和MUG-Chor1的基因表达谱数据，采用芯片平台GPL17692（人类）
基本信息
资源简介
LIF处理的脊索瘤细胞系U-CH1和MUG-Chor1表达数据
GSE86036 是一个来源于 NCBI 的基因表达谱数据集，全称为“Expression data from LIF treated chordoma cell lines U-CH1 and MUG-Chor1”，即经白血病抑制因子（LIF）处理的脊索瘤细胞系 U-CH1 与 MUG-Chor1 的表达数据。该数据集采用表达谱芯片技术，平台编号为 GPL17692，物种为人类（9606），共包含 1 个数据文件，样例文件名为 GSE86036_series_matrix.txt.gz。数据集由 Sukru Gulluoglu 提交，发布时间为 Aug 25 201，主题标签涵盖 Expression profiling by array、GPL17692 与 9606。整体而言，该数据集围绕 LIF 处理后的脊索瘤细胞系表达变化展开，可用于了解该细胞因子在肿瘤细胞中的转录响应特征。
【数据集背景】
白血病抑制因子（Leukemia Inhibitory Factor，LIF）是白细胞介素（IL）家族中的重要细胞因子。源站描述指出，近期研究发现 LIF 在癌症进展中可能发挥关键作用。该数据集正是针对这一背景，对脊索瘤细胞系 U-CH1 和 MUG-Chor1 在 LIF 处理后的基因表达进行芯片检测，以获取表达层面的实验数据。脊索瘤相关研究属于肿瘤研究范畴，本站将其归入肿瘤 / 白血病分类之下。
【数据内容】
数据集包含经 LIF 处理的脊索瘤细胞系 U-CH1 和 MUG-Chor1 的表达谱数据，检测对象为人类样本，采用表达谱芯片平台 GPL17692。数据以 series matrix 文件形式组织，文件名为 GSE86036_series_matrix.txt.gz。文件数量为 1。数据内容聚焦于 LIF 处理条件下两种脊索瘤细胞系的基因表达特征，属于表达谱层面的实验记录。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号 GSE86036，源站标题与数据集英文名一致。提交者为 Sukru Gulluoglu，发布时间为 Aug 25 201。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL17692 和 9606，分别对应芯片表达谱技术、芯片平台编号与人类物种标识。除上述信息外，样本处理细节、实验设计、生物学重复数量等源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 LIF 处理对脊索瘤细胞系基因表达的影响，可用于表达谱层面的差异分析探索，也可作为肿瘤细胞因子响应相关研究的参考数据。由于涉及 U-CH1 与 MUG-Chor1 两种脊索瘤细胞系，适合用于细胞系间表达特征的比较性分析。具体分析设计与结论需结合源站原始记录判断，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE86036_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式。读取时应按文件格式解压并解析，建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。源站未提供其他使用说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，样本量、重复数、质控指标等信息源站未提供。数据为芯片表达谱，平台为 GPL17692，物种为人类。使用时应关注芯片数据的常规局限性，但该数据集的具体质量评估信息源站未提供。
【引用与许可】
数据集作者为 Sukru Gulluoglu，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号 GSE86036。许可信息与引用规范源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86036
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
白血病抑制因子是IL家族的重要细胞因子。近期研究发现其在癌症进展中具有关键作用。我们使用微阵列技术监测了两种脊索瘤细胞系经LIF处理3周后基因表达的全局变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
