ibrutinib治疗后慢性淋巴细胞白血病患者miR表达差异数据集
该数据集来自NCBI,聚焦慢性淋巴细胞白血病患者在接受ibrutinib治疗后的miR表达差异,采用芯片进行非编码RNA表达谱分析,物种为人类(9606),平台为GPL16142

基本信息
资源简介
ibrutinib治疗后慢性淋巴细胞白血病患者miR表达差异数据集
GSE84801 数据集来自 NCBI,主题为慢性淋巴细胞白血病患者在接受 ibrutinib 治疗后的 miR 表达差异。该数据集采用芯片技术进行非编码 RNA 表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL16142,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE84801_series_matrix.txt.gz。数据集由 Amy、Johnson 提交,发布时间为 Jul 25 201。该数据集属于肿瘤 / 白血病分类,可用于了解 ibrutinib 治疗后 miR 表达变化的相关研究。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病是一种血液系统恶性肿瘤,ibrutinib 是用于该类疾病治疗的药物。该数据集关注患者在接受 ibrutinib 治疗后 miR 表达的变化情况。源站描述指出,研究发现 ibrutinib 治疗后 miR 受到显著的差异调控。数据集标题也直接表明其主题为慢性淋巴细胞白血病患者经 ibrutinib 治疗后的 miR 表达差异。该数据集属于肿瘤 / 白血病分类,聚焦非编码 RNA 表达谱分析。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE84801_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。数据集主题标签包括 Non-coding RNA profiling by array、GPL16142 和 9606,表明其采用芯片进行非编码 RNA 表达谱分析,物种为人类,平台为 GPL16142。源站描述提到,miR 在 ibrutinib 治疗后被发现受到显著差异调控。数据集的具体样本数量、分组信息、表达矩阵字段等源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 miR expression differences in Chronic lymphocytic leukemia patients after ibrutinib therapy。作者为 Amy、Johnson,发布时间为 Jul 25 201。数据集分类为肿瘤 / 白血病。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于非编码 RNA 表达谱分析相关研究,特别是慢性淋巴细胞白血病患者接受 ibrutinib 治疗后 miR 表达差异的探索。由于采用芯片平台 GPL16142 且物种为人类,可用于比较治疗前后 miR 表达变化、筛选差异表达的 miR 等分析场景。具体适用分析类型及研究设计细节,源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE84801_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。关于数据预处理、归一化及分析流程等细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,样例为 GSE84801_series_matrix.txt.gz。关于样本量、数据完整性、缺失值情况、质控指标等信息,源站未提供。使用时应注意数据集仅覆盖芯片平台 GPL16142 的非编码 RNA 表达谱,其他平台或数据类型未涉及。具体限制条件源站未提供。
【引用与许可】
该数据集作者为 Amy、Johnson,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可协议及使用条款等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE84801
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
研究发现,伊布替尼治疗后miRs的调控存在显著差异。收集治疗前、治疗后2小时、24小时、8天、29小时的外周血CLL细胞样本,提取RNA并用于miR nanostring分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




