GSE77788：PI3Kδ阻断增加B细胞基因组不稳定性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE77788

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

活化诱导胞苷脱氨酶（AID）是一种B细胞特异性酶，其靶向免疫球蛋白（Ig）基因以启动类别转换重组（CSR）和体细胞超突变（SHM）。然而，通过脱靶活性，AID通过启动致癌性染色体易位以及参与淋巴瘤发生和进展的突变，对基因组不稳定性产生更为广泛的影响。AID在B细胞中的表达受到严格调控，其过表达会导致基因组不稳定性增强和淋巴瘤形成。磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）δ通路通过抑制B细胞中AID的表达，在AID调控中发挥关键作用。用于白血病或淋巴瘤治疗的新型药物，如idelalisib、duvelisib或ibrutinib，直接抑制PI3Kδ活性，或通过抑制布鲁顿酪氨酸激酶（BTK）间接抑制其活性，从而可能影响AID表达，并进而影响B细胞的基因组稳定性。

我们在此展示，用idelalisib或duvelisib处理原代小鼠B细胞，以及较小程度上用ibrutinib处理，均能增强AID的表达，并增加体细胞高频突变（SHM）和染色体易位至Igh位点及几个AID脱靶位点的频率。这些效应在AID缺陷的B细胞中完全消失。PI3Kδ抑制剂或ibrutinib增加了经pristane处理小鼠中AID依赖性肿瘤的形成。一致地，PI3Kδ抑制剂在人慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系中增强了AID表达及向IgH和AID脱靶位点的易位频率，而接受idelalisib治疗的患者显示AID脱靶位点的SHM增加。总之，我们发现PI3Kδ或BTK抑制剂通过AID依赖机制增加正常和肿瘤性B细胞的基因组不稳定性。鉴于此类抑制剂需多年给予患者，规划治疗方案时应仔细考虑其基因毒性潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。