CLL外泌体调控受体基质细胞转录组与行为并在miR-202-3p选择性富集 [mirBase 13]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE70994

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数据说明

与微环境的双向通讯对于癌细胞的归巢和存活至关重要，并对疾病生物学和行为产生影响。在慢性淋巴细胞白血病（CLL）中，微环境对恶性细胞行为的作用已被充分描述。然而，CLL细胞如何接触并招募滋养细胞尚不清楚。在此，我们证明CLL细胞分泌外泌体——一种起源于多囊泡体与质膜融合的纳米囊泡——将蛋白质、脂质、microRNA（miR）和mRNA转运至受体细胞。我们通过电子显微镜（EM）、原子力显微镜（AFM）、流式细胞术和蛋白质印迹，使用外泌体特异性和CLL特异性标志物，对CLL来源外泌体的大小（50-100 nm）和身份进行了表征和确认。将来源于细胞培养上清或患者血浆的CLL外泌体与人基质细胞孵育，结果显示它们易于被内吞入内体，并诱导c-fos和ATM等基因的表达，同时促进受体HS-5细胞的增殖。

此外，我们发现慢性淋巴细胞白血病（CLL）外泌体包裹了大量小RNA，并富集于某些miR，特别是hsa-miR-202-3p。我们认为，miR-202-3p的这种特异性包装影响了亲代CLL细胞中Hedgehog（Hh）信号通路中间体“融合抑制因子”（Sufu）的表达。因此，我们的数据表明，CLL细胞分泌的外泌体能改变受体细胞的转录组和行为。这种与微环境的交流可能在CLL疾病生物学中发挥重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。