人类白血病B细胞基因表达谱:双色微阵列基因表达分析

该数据集来自 NCBI,聚焦人类白血病 B 细胞的基因表达谱,采用双色微阵列平台(GPL16699,物种 9606)进行分析

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL166999606
GSE68094: Gene Expression Profiling of human leukemic B-cells. Two-color Microarray-Based Gene Expression Analysis.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

人类白血病B细胞基因表达谱:双色微阵列基因表达分析

Gene Expression Profiling of human leukemic B-cells. Two-color Microarray-Based Gene Expression Analysis.

该数据集来自 NCBI,聚焦人类白血病 B 细胞的基因表达谱,采用双色微阵列平台(GPL16699,物种 9606)进行分析。数据涉及慢性淋巴细胞白血病 MEC1 细胞,在体外培养中分别经糖树状分子(表面带麦芽三糖的纳米颗粒)处理与未处理,用于比较处理前后的表达差异。数据集仅含 1 个文件(GSE68094_series_matrix.txt.gz),可用于白血病细胞药物/纳米颗粒应答相关的表达谱分类与差异分析研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 21 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):新鲜 MEC1 细胞(慢性淋巴细胞白血病)(ACC-497,DSMZ)此前未经处理,在体外培养中经糖树状分子(表面带麦芽三糖的纳米颗粒)处理。MEC1 细胞与药物或树状分子孵育后离心。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL16699、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68094

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 27 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

新鲜MEC1细胞(慢性淋巴细胞白血病)(ACC-497,DSMZ),此前未经处理,并在体外培养中用糖树枝状聚合物(表面带有麦芽三糖的纳米颗粒)处理。与药物或树枝状聚合物孵育后,对MEC1细胞进行离心。使用Agilent的Low Input Quick Amp Labeling Kit生成荧光cRNA(互补RNA),双色处理时总RNA样本输入量为100ng。该方法使用T7 RNA聚合酶,可同时扩增目标物质并掺入花菁3-或花菁5-标记的CTP。使用该试剂盒时,从总RNA到cRNA的扩增通常至少为100倍。cRNA定量使用NanoDrop ND-1000 UV-VIS分光光度计3.2.1版完成。将芯片置于垫圈上,然后放入杂交炉中旋转架上的载玻片室。杂交在65摄氏度下进行17小时。使用Agilent扫描仪对芯片进行扫描。扫描分辨率设置为3μM。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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