人类白血病B细胞基因表达谱:双色微阵列基因表达分析
该数据集来自 NCBI,聚焦人类白血病 B 细胞的基因表达谱,采用双色微阵列平台(GPL16699,物种 9606)进行分析

基本信息
资源简介
人类白血病B细胞基因表达谱:双色微阵列基因表达分析
Gene Expression Profiling of human leukemic B-cells. Two-color Microarray-Based Gene Expression Analysis.
该数据集来自 NCBI,聚焦人类白血病 B 细胞的基因表达谱,采用双色微阵列平台(GPL16699,物种 9606)进行分析。数据涉及慢性淋巴细胞白血病 MEC1 细胞,在体外培养中分别经糖树状分子(表面带麦芽三糖的纳米颗粒)处理与未处理,用于比较处理前后的表达差异。数据集仅含 1 个文件(GSE68094_series_matrix.txt.gz),可用于白血病细胞药物/纳米颗粒应答相关的表达谱分类与差异分析研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 21 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):新鲜 MEC1 细胞(慢性淋巴细胞白血病)(ACC-497,DSMZ)此前未经处理,在体外培养中经糖树状分子(表面带麦芽三糖的纳米颗粒)处理。MEC1 细胞与药物或树状分子孵育后离心。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL16699、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68094
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 27 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68094
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
新鲜MEC1细胞(慢性淋巴细胞白血病)(ACC-497,DSMZ),此前未经处理,并在体外培养中用糖树枝状聚合物(表面带有麦芽三糖的纳米颗粒)处理。与药物或树枝状聚合物孵育后,对MEC1细胞进行离心。使用Agilent的Low Input Quick Amp Labeling Kit生成荧光cRNA(互补RNA),双色处理时总RNA样本输入量为100ng。该方法使用T7 RNA聚合酶,可同时扩增目标物质并掺入花菁3-或花菁5-标记的CTP。使用该试剂盒时,从总RNA到cRNA的扩增通常至少为100倍。cRNA定量使用NanoDrop ND-1000 UV-VIS分光光度计3.2.1版完成。将芯片置于垫圈上,然后放入杂交炉中旋转架上的载玻片室。杂交在65摄氏度下进行17小时。使用Agilent扫描仪对芯片进行扫描。扫描分辨率设置为3μM。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




